Sequence alignment for CL0505

PF00805

A0B7Y5_METTP/89-128-----ANLEGA---S---------------------------------------LA----GADLSMAD---------LSG
A0B7Y5_METTP/179-218-----ANFVGA---H---------------------------------------LS----WADMSRSR---------FRE
A0KF03_AERHH/96-135-----INFSRA---S---------------------------------------FA----NQITVKSY---------FCE
A0L9N7_MAGMM/1734-1773-----AILNDV---N---------------------------------------LS----GATLGGLS---------LAG
A0ZBG8_NODSP/154-193-----ANLSNV---D---------------------------------------LM----WAYLGLAI---------LYE
A0ZHL0_NODSP/390-429-----ANLNAA---K---------------------------------------LQ----QTEIIFAD---------LRE
A0ZJD9_NODSP/103-142-----ARLIKA---N---------------------------------------LT----NAILEGAF---------ASN
A0ZM12_NODSP/140-179-----SNLSGV---N---------------------------------------LT----EADLVGVS---------LEQ
A1BFB8_CHLPD/86-125-----SDLSNA---N---------------------------------------LR----NASLDGAR---------MSG
A1SQY4_PSYIN/691-730-----AKLINA---N---------------------------------------CQ----GANIGAAN---------LSD
A1SQY5_PSYIN/95-134-----ANFIDA---N---------------------------------------FA----QADLSDAN---------LEN
A1SQZ0_PSYIN/254-293-----SDFRDC---Q---------------------------------------LE----QALFNEAT---------VRQ
A1WXY7_HALHL/73-112-----ADLTSV---S---------------------------------------AA----GINLRDAN---------LSR
A3I161_9BACT/25-64-----CDFTQC---D---------------------------------------FS----GLDLRGFS---------FEN
A4VDH1_TETTS/279-318-----AKFSNA---D---------------------------------------LQ----GASLQNSI---------FDE
A4VLT0_PSEU5/168-207-----ADLTDA---N---------------------------------------LQ----EAKLNDAN---------LAD
A4XCZ7_SALTO/151-190-----CNLQGA---D---------------------------------------FT----NADLRGAT---------FRG
A4XTQ1_PSEMY/146-185-----AKLHNV---Q---------------------------------------LQ----AANLEMTW---------LSK
A5GBT3_GEOUR/693-732-----INLSNV---D---------------------------------------LT----NVNLTGTN---------LTN
A5V7P4_SPHWW/82-121-----AQFTGA---Q---------------------------------------LG----EARFTASD---------FNN
A6WAJ1_KINRD/52-91-----CSFDGA---D---------------------------------------LR----QATLDGMH---------LKL
A8DZF0_DANRE/258-297-----TNLERA---D---------------------------------------LS----SANLDGAN---------LQG
A8ZLL7_ACAM1/105-144-----AKLSAA---Q---------------------------------------LK----RTDFSQAN---------LMG
A8ZLL7_ACAM1/170-209-----AQLSES---D---------------------------------------LS----WSFLSQAV---------CVG
A8ZLL8_ACAM1/107-146-----ADLHEA---D---------------------------------------LS----FATLLKAD---------LST
A8ZLL8_ACAM1/177-216-----ADLEAV---E---------------------------------------FE----AVRASKAD---------FTQ
A9C0H0_DELAS/87-126-----ANLTDA---L---------------------------------------FC----QSDLNNTN---------WEL
A9FK95_SORC5/268-307-----AELVEA---Y---------------------------------------LA----FASCAGAR---------FVG
A9FQA8_SORC5/233-272-----ADLAGA---A---------------------------------------LE----GMDFAGVS---------FEN
A9GAK7_SORC5/700-739-----ASLADA---D---------------------------------------VR----GAALPGAH---------FTG
A9GAL0_SORC5/134-173-----AKLDRI---R---------------------------------------LD----FAKLPGAE---------LAG
A9IN70_BORPD/583-622-----ALLQRC---V---------------------------------------LR----QADLERSN---------FLE
A9S7Y1_PHYPA/177-216-----CDLRDA---N---------------------------------------LE----YCDAGGAN---------FRN
A9S7Y1_PHYPA/227-266-----ARLKNA---S---------------------------------------LR----KTIAVRAE---------FND
B0C4N5_ACAM1/43-82-----CDLAGA---N---------------------------------------LR----SFELQNGN---------LKN
B0CCX9_ACAM1/168-207-----ASLLRT---N---------------------------------------LT----FANFTRAD---------LSN
B0CE43_ACAM1/98-137-----AQLIRA---D---------------------------------------LT----HADLQNAN---------LQQ
B0CG68_ACAM1/181-220-----SDLREA---N---------------------------------------FN----KSNLKNAT---------LNQ
B1WNM4_CROS5/70-109-----ANLQGV---R---------------------------------------FF----ASNLEGAN---------FEG
B1WW28_CROS5/558-597-----ANLVKS---D---------------------------------------LT----NSNFKNAN---------LTN
B1WWY1_CROS5/60-99-----ANLTNV---R---------------------------------------LQ----GANLTETN---------FIA
B1X010_CROS5/44-83-----AYLTNA---S---------------------------------------LR----NAILNEAN---------LEK
B1X1Y6_CROS5/340-379-----ADLTEA---D---------------------------------------LC----NGMLQGAN---------LEG
B6IP87_RHOCS/159-198-----ADLSRA---R---------------------------------------VS----NAFVIQTD---------LTD
B6IRL7_RHOCS/132-171-----ADLDDA---L---------------------------------------LS----NANLAGAD---------LGE
B7JVU3_RIPO1/101-140-----SSFRDA---D---------------------------------------LS----DAILSEVI---------MLR
B7JYR6_RIPO1/472-511-----SELSRA---D---------------------------------------FG----RTSLTDFN---------GKN
B7K041_RIPO1/169-208-----ANLFQA---Q---------------------------------------LI----ETHLSHSY---------FLR
B7K312_RIPO1/188-227-----ADLMEV---D---------------------------------------LS----YSNLYKAD---------LSE
B7K7F4_GLOC7/148-187-----ANLSGA---K---------------------------------------LN----EVKLDETN---------LSH
B7K8G0_GLOC7/130-169-----CIFINL---N---------------------------------------LE----GANLIGAN---------FAN
B7KBE1_GLOC7/74-113-----ADLTEA---N---------------------------------------LI----GTTCKKTN---------FRR
B7KHQ6_GLOC7/55-94-----ACFFGA---D---------------------------------------LS----EAILWGTD---------FTG
B7KJA4_GLOC7/91-130-----ANLSGA---N---------------------------------------LR----GAIVNGTD---------FRN
B8HVC5_CYAP4/94-133-----TNLTEV---N---------------------------------------FS----EANLIKAN---------LVH
B9JAV7_AGRRK/157-196-----AQLANV---D---------------------------------------FQ----KAELGRAD---------FDK
B9KGW3_ANAMF/252-291-----ARLFGA---N---------------------------------------LN----GARIQNSV---------LKG
C1A3W2_GEMAT/148-187-----CNFEFA---N---------------------------------------LN----GLRLREGD---------LRE
C5C2K4_BEUC1/133-172-----SRLRRV---R---------------------------------------FE----GVDASGLE---------LID
C6BX13_DESAD/984-1023-----CQLQKT---N---------------------------------------FK----GAILDNVK---------FVQ
D0LX79_HALO1/166-205-----ASLSRA---V---------------------------------------FT----GATLIDVD---------LRG
D2VTX2_NAEGR/583-622-----TNFTSA---N---------------------------------------LT----GGSLGGAN---------LSG
D2VX03_NAEGR/251-290-----SDLSCC---N---------------------------------------LS----NSNLENID---------FDS
D2W263_NAEGR/485-524-----SDLSNS---N---------------------------------------FT----NCNAIDCN---------LES
D3BL15_POLPP/460-500-----AILYGC---D---------------------------------------LS----HCDLTECD---------FTN
D3FSK0_ALKPO/134-173-----ANCKWV---A---------------------------------------FE----HTLLNRAD---------FYE
D4ZUG9_ARTPN/149-188-----ANLSYA---N---------------------------------------FH----EAVLINAI---------GYQ
D4ZXB3_ARTPN/47-86-----SNLKEA---S---------------------------------------LA----RAYLERCF---------MLE
D4ZXB3_ARTPN/207-246-----AKMAGA---N---------------------------------------LQ----GTNLKDSQ---------MRF
D6ZD82_SEGRD/147-186-----SILRGA---D---------------------------------------FQ----EAALAQSR---------LVR
D7C334_STRBB/127-166-----ARLTDV---V---------------------------------------FE----GCVLAEAD---------FGG
E8RT29_ASTEC/33-72-----ASCSGC---N---------------------------------------LF----QADFSGKT---------LKG
F2UC71_SALR5/289-328-----AIMKGA---K---------------------------------------LT----GTDMSHVD---------LTT
F2UC71_SALR5/719-758-----ANMQDA---T---------------------------------------LK----ACSLLGAN---------LRE
F4BVN6_METSG/276-315-----AILAGA---T---------------------------------------LR----NAKLDRVN---------LRE
F4GSE2_PUSST/705-744-----ANLESA---V---------------------------------------FH----QCAMEGAL---------FSK
F4GSE2_PUSST/761-800-----ANMQGA---N---------------------------------------LE----DASLQDSC---------LLR
F6ZYT4_CIOIN/114-153-----SEFTGS---D---------------------------------------FT----HSKYNGAD---------FTG
F8A9P8_THEID/105-144-----ADFSLA---R---------------------------------------LR----EADLREAD---------FSG
F8B115_9ACTN/142-181-----CLLRDV---D---------------------------------------FG----GATLAGVT---------FPG
F8J6R8_HYPSM/219-258-----CNLSNA---D---------------------------------------FS----RASLAHAD---------LSD
F8J7S7_HYPSM/191-230-----CDFSGA---R---------------------------------------LE----DANMTRAV---------LWF
G7ZDA3_AZOL4/135-174-----ARLRGA---N---------------------------------------LE----FARATGAD---------FTG
G8AMD0_9PROT/267-306-----ARLRRC---R---------------------------------------LM----GVRLRKAS---------LEM
H6L8D8_SAPGL/147-186-----ASLVGV---N---------------------------------------LE----KTNLEGAS---------LRE
H8MF57_CORCM/807-846-----ARCYRT---V---------------------------------------FS----GANLRGAR---------FEG
I0K2Q5_9BACT/328-367-----TNFMSA---V---------------------------------------LD----GCNLTGKN---------LTN
I1IC12_BRADI/97-136-----AQFGNA---D---------------------------------------LK----KTVHVNEN---------FRR
I4C4D9_DESTA/310-349-----SILVSA---N---------------------------------------FS----NAQMQGAV---------LTR
K0J5X5_AMPXN/137-176-----CLLNEV---D---------------------------------------FY----HSKWSNIF---------FEK
K0JPG9_SACES/62-101-----SNLADV---V---------------------------------------LR----GTELWGAH---------CEQ
K8GJG9_9CYAN/110-149-----ADMGGA---N---------------------------------------LA----FAKLDQVN---------LER
K9RE40_9CYAN/266-305-----TNLSNA---D---------------------------------------LT----SAKLRETF---------PSN
K9RH79_9CYAN/35-74-----INFSQC---T---------------------------------------LT----QANLQNIN---------LSK
K9S6L2_9CYAN/95-134-----ANLEGA---N---------------------------------------LT----GALADRVF---------WLD
K9SD61_9CYAN/87-126-----ANFRGV---N---------------------------------------LE----QANLCGAD---------LRG
K9SI82_9CYAN/141-180-----ASLREA---R---------------------------------------LS----QACLLSTF---------MNW
K9SSF9_9SYNE/190-229-----SNLSQA---N---------------------------------------FE----EANFLGTN---------FSR
K9STB1_9SYNE/89-128-----TNFTLA---N---------------------------------------LS----SSILSGIS---------LRG
K9TRR3_9CYAN/205-244-----AQLDGA---K---------------------------------------MN----GSLVDGAD---------LSQ
K9UPM8_CHAP6/192-231-----ARLSRA---H---------------------------------------LV----SVYAVCAN---------FDR
K9V704_9CYAN/120-159-----AELSGT---D---------------------------------------FS----GAILSYAN---------LTA
K9VXL1_9CYAN/190-229-----AELSRA---K---------------------------------------IS----GTNLTKAI---------FNG
K9VYD8_9CYAN/281-320-----ADLVDA---Y---------------------------------------LA----KADLEGAN---------LTN
K9W8L7_9CYAN/99-138-----SNLSQA---N---------------------------------------LI----GASLPETD---------LQV
K9WPM3_9CYAN/432-471-----SQFKGA---D---------------------------------------LR----GNDLNHTD---------LRH
K9WQQ6_9CYAN/93-132-----ANLKNT---K---------------------------------------LK----DAKMSGAR---------LNQ
K9XY80_STAC7/307-346-----AKLNLV---K---------------------------------------FE----QTKLIEAE---------LKN
K9XZ67_STAC7/59-98-----ACLDHA---Q---------------------------------------LI----DANLQGAN---------LLA
K9YF14_HALP7/250-289-----ASLDNV---N---------------------------------------LS----QANLHRTR---------MIR
K9YL25_CYASC/32-71-----ANLSGT---N---------------------------------------FA----HSDLRQSR---------LGQ
K9YLZ6_CYASC/155-194-----ADLTRA---N---------------------------------------LS----ASNLQGCS---------FNE
K9YNF4_CYASC/198-237-----TNLHHA---D---------------------------------------LS----GANLSQSS---------FIN
K9Z2G7_CYAAP/15-54-----TNFQKV---D---------------------------------------LQ----NQKLTNTV---------LHR
K9Z6R1_CYAAP/392-431-----INFRNC---Q---------------------------------------LI----RVNFEEAN---------LEG
K9Z892_CYAAP/730-769-----CCLDNI---N---------------------------------------LI----GSNLEKIN---------FQQ
L0DC37_SINAD/31-70-----AYFKDS---S---------------------------------------LR----ATNLSGSF---------LNS
L0DTJ7_SINAD/37-76-----SDCSGS---N---------------------------------------FS----NTNLRYAD---------FRG
L0GQS5_9GAMM/836-875-----CRFQEA---H---------------------------------------LD----RARFSQCR---------LRS
M4SE31_9SPHN/86-125-----ADLTEA---A---------------------------------------FA----SCDFNNAV---------FRR
M4SE31_9SPHN/131-170-----ASFEET---L---------------------------------------LI----GAKLAGHS---------FRG
YISX_BACSU/143-182-----SECSDT---V---------------------------------------LQ----QTHFDGCE---------LEG
YYBG_BACSU/174-213-----SELVRA---Q---------------------------------------AR----HPKLPKKV---------SRG
Y1819_SYNY3/231-270-----AEMTAV---N---------------------------------------CQ----GAIMTHVN---------LNR
P73963_SYNY3/118-157-----CNLSEA---D---------------------------------------LT----ESDANEAL---------FCQ
Y1152_SYNY3/90-129-----CQMNWA---D---------------------------------------LT----YAKLNQAD---------LSH
Y1152_SYNY3/185-224-----ANLRDA---R---------------------------------------LW----ATDLRRAF---------MKE
Q03I28_PEDPA/70-109-----SIFVGC---D---------------------------------------FS----NCKMEEAV---------FYR
Q0ALQ7_MARMM/147-186-----ANFTGA---N---------------------------------------LS----HSKMAGIA---------AQK
Q10WP6_TRIEI/67-106-----ANLNQA---N---------------------------------------LQ----GCNLLEVK---------MGD
Q113G1_TRIEI/83-122-----ANLTEA---D---------------------------------------FT----GTFADRVS---------FDK
Q184I8_CLOD6/74-113-----SYLSDC---S---------------------------------------LK----NSILKNAD---------LSG
Q2GFB5_EHRCR/259-298-----SNISFA---N---------------------------------------FH----NANLSNTN---------MHL
Q2JMK9_SYNJB/84-123-----AELERA---N---------------------------------------FT----ASDLRGSS---------FSQ
Q31RN7_SYNE7/33-72-----CNFYAV---D---------------------------------------LR----FRRLPNAQ---------LAG
Q39WD6_GEOMG/72-111-----CRMMGT---N---------------------------------------LR----GAILAGTD---------LDG
Q55531_SYNY3/57-96-----AVFAAA---D---------------------------------------LR----ESNFEGSD---------LSF
Q63K60_BURPS/281-320-----ADCAEA---T---------------------------------------LA----GGHFVYCD---------FSH
Q63NW6_BURPS/562-601-----AKLVDA---R---------------------------------------LT----AANLSLAH---------CER
Q74B06_GEOSL/107-146-----AHCSGA---Y---------------------------------------IH----HAKFVGAN---------LSG
Q837D8_ENTFA/97-136-----CNLTGT---N---------------------------------------FA----DSYLKDCL---------FED
Q8DHT2_THEEB/40-79-----ASLQGV---Y---------------------------------------FQ----FCHFGRAD---------FSD
Q8DKZ0_THEEB/100-139-----AELSET---T---------------------------------------LR----GTVLQGAN---------LSR
Q8NPC6_CORGL/149-188-----CCFSGA---N---------------------------------------FG----ECSWQYAR---------LTN
PIPB2_SALTY/287-326-----AVLTRA---N---------------------------------------LR----KASFISTN---------LDG
Q9K676_BACHD/63-102-----SSFSRS---D---------------------------------------LS----DVVFEKCD---------LSN
Q9ZCY8_RICPR/136-175-----SIFNNI---T---------------------------------------LQ----NTNFVQSN---------FSD
Q9ZCY8_RICPR/519-558-----SILKDA---N---------------------------------------FS----AAILTKTD---------FSK
R5JCA5_9FIRM/26-65-----SEFENV---N---------------------------------------FN----GAVFDGAI---------LDN
R6CJY4_9FIRM/60-99-----CRFTDC---N---------------------------------------FE----KVYFKDCE---------FSG
R6CRW1_9CLOT/120-159-----CNLRYA---S---------------------------------------LS----GSKLKAVE---------FNG
R6ZHW4_9FIRM/759-798-----CRFERS---T---------------------------------------FC----DSDFRNSF---------LTD
U4KBL8_9VIBR/57-96-----CQFQYA---N---------------------------------------LK----DASFKNCQ---------LAL
U5QJZ6_9CYAN/177-216-----CDLRRA---Y---------------------------------------LS----RSWLTNCN---------LSA
W0PDU8_ADVMD/278-317-----SILHEA---N---------------------------------------CE----NARWNRSD---------LTR
W0PEX0_ADVMD/860-899-----CSFAHA---Q---------------------------------------FR----QCNLRGLQ---------LDG
W1NDZ3_AMBTC/188-227-----ANLREC---E---------------------------------------FI----SANLGGAV---------LAG

PF13576

B5H984_STRE2/125-173--FDQAQFSGD-A-V---------------------------------------FS----EVRFAGDA----G----FSG
B5H984_STRE2/202-250--FNETHVTGD-A-V---------------------------------------FD----RATFSGPA----G----FRE
A0B5U2_METTP/99-147--FASAVFSDG-A-F---------------------------------------FD----RIVVSGDA----S----FEG
A0B9T1_METTP/112-160--INGVEFMGP-L-N---------------------------------------LS----GTVFSGDV----A----ARG
A0B9T1_METTP/167-215--FVGTNFHGP-V-S---------------------------------------MG----YAQFSKVG----S----FEG
A0B9T1_METTP/233-281--FWRSVFHEE-V-S---------------------------------------FA----NSEFSGTA----N----FIS
A0ZD13_NODSP/318-366--FSSVRFAET-A-Q---------------------------------------FT----KANFHQYI----F----FTE
A1Z8W1_DROME/753-797--LQEPNLQDA---I---------------------------------------LQ----EPNLQEP-----N----LQD
A2U1F0_9FLAO/177-225--FKYSEFRRN-V-S---------------------------------------FA----GSVFEDSA---I-----FKY
E0THL3_PARBH/139-184--FSGFVWRMR-C-N---------------------------------------FR----NTRWLEVT---------AEN
A4FAP0_SACEN/197-246--FADARFHGA-A-V---------------------------------------FR----GTTFDRSA----D----FRN
A4FQH2_SACEN/233-281--AYRCRFRHT-T-N---------------------------------------FK----GARIHGDV----A----LRD
A4ICH5_LEIIN/198-242--LRKANMAGA---Q---------------------------------------FH----SCTFLST-----D----ASA
A6UVV6_META3/208-256--FTHTQFKKY-A-E---------------------------------------FT----SALFNKKV----G----FYH
A7RX60_NEMVE/30-74--FTGALFTGV---Y---------------------------------------FT----GALCTGVY---------FTG
A7SIC1_NEMVE/41-85--FYGSTFYGS---T---------------------------------------FY----GSTFYGST---------FYG
A7SRL0_NEMVE/96-140--IRQVDMRQV---D---------------------------------------MK----EVDMRQD-----N----MRE
A8EV36_ARCB4/203-251--FYKTTFKDI-S-V---------------------------------------FT----ETIFNKKV----D----FKH
B0G184_DICDI/190-234--YQHTRFEGC---I---------------------------------------FQ----ECNINSS-----S----FIE
B0JQ65_MICAN/139-187--WVESRFARV-A-K---------------------------------------FT----KATFMGDV----N----FSQ
B0JQ65_MICAN/216-264--FSQSQWRDR-P-L---------------------------------------FS----KSRFLSLL---T-----FRN
B3U4K5_9BACT/153-201--LSRTVFLGL-V-D---------------------------------------GS----NATFRQES---Y-----FVQ
B3U4K5_9BACT/252-300--FSSSQFDRE-A-F---------------------------------------FL----FAIFDRMA---T-----FAS
B5GS14_STRCL/232-284--FGRAVFRDA-RVS---------------------------------------FE----NALFTGGI---VD----FGR
B5GS14_STRCL/328-380--LVRTVLSGGWA-D---------------------------------------FR----QAVFKGGI---VD----FTQ
B5GW00_STRCL/88-136--FDEVRFTGD-A-E---------------------------------------LE----GIDFGGFC----S----FAS
B5GW00_STRCL/176-223--FKGMMCGDA---Y---------------------------------------FS----GARMAGVT----S----FSE
B5IFQ8_ACIB4/85-132--FREIEFRGD-V-K---------------------------------------FD----DAVFEFTP----E----FNN
B7KEX0_GLOC7/178-226--ALDANFKEE-T-N---------------------------------------FS----GATFARIA----D----FSQ
B7KEX0_GLOC7/255-303--FSQIQWLGK-A-S---------------------------------------LS----QTHWRDRV---L-----FSK
B7QLD9_IXOSC/210-254--FTNCSFINS---S---------------------------------------FS----DVHSSRS-----F----FRQ
B8GI24_METPE/90-138--FNRATFEGD-A-S---------------------------------------FV----EVNFKGGA----S----FEG
B8GI24_METPE/178-226--FEGATFDRF-A-G---------------------------------------FN----GATFDGNS----K----FNR
B8GI24_METPE/244-292--FNGATFDGN-S-R---------------------------------------FN----RATFHGDA----N----FEG
B8GI24_METPE/315-362--FNNANIQRK-I-C---------------------------------------FD----NCKIKNI-----S----FSG
B8HPH9_CYAP4/218-266--WSQSRFSQL-V-S---------------------------------------FT----GSTFNQTA----R----FRN
B8HPH9_CYAP4/295-343--FAQSHWQGT-A-L---------------------------------------LT----RNQFDQSL----F----LTE
B9JIK6_AGRRK/26-71--LRGAHFSGA-E-A---------------------------------------LH----GCTWIGN-----R----IEN
C0QEU2_DESAH/556-605--FFGVSLESA---R---------------------------------------MT----DCVFTGAQ---IST-SLFVR
E8RMD0_ASTEC/266-314--FDGCDFGEG-V-S---------------------------------------FR----AATFGGPV---T-----FRG
C6BSE6_DESAD/72-120--FTKSIFLGK-T-S---------------------------------------FR----KVRFEGST----Y----FNE
C6BSE6_DESAD/185-233--FKYAIFHDY-S-N---------------------------------------FE----HTKFNGGA----D----FNL
C6BYH9_DESAD/482-531--LEECIFKNC---T---------------------------------------FE----GCTFSNTT----FLESEFEN
C6C206_DESAD/124-172--FKNAVFLQG-V-S---------------------------------------FI----QSHFKSDV----N----FEQ
C6C206_DESAD/276-324--FELMEFKGP-A-Y---------------------------------------FT----KSFFSNDV---T-----FKN
C6HJW2_AJECH/566-610--FDNAPFDNA---P---------------------------------------FG----NAPFGNA-----P----FGN
C6W9W0_ACTMD/153-201--LTGAVFLGD-A-R---------------------------------------LR----AMTVTGPA---T-----FAQ
C6W9W0_ACTMD/219-267--LAGARVSGR-A-D---------------------------------------LS----GAELTGPA----D----FTG
C6WQX5_ACTMD/283-331--FERSKFLGP-T-K---------------------------------------FA----DARFTGTV---T-----FDG
C6XQJ8_HIRBI/307-355--FKKTTFKKS-L-R---------------------------------------IK----GCQFLNSV----D----FSD
C6XWZ7_PEDHD/191-235--IQYSHIGNN---L---------------------------------------FK----DCSLKEAA---------FLK
C7NY76_HALMD/73-120--FRNCTFEGA-V-S---------------------------------------AV----DADVTVPI----S----FEN
C7NY76_HALMD/304-352--FDGITVNGP-A-T---------------------------------------FE----GIRFDGDA----S----FEA
C7PX43_CATAD/315-366--LSESSLRGT-I-D---------------------------------------FR----DARLAGGV---MR----FDG
C7Q3Y4_CATAD/215-264--FVDTEFDGI-C-E---------------------------------------FD----HTAFYGGA---I-----FRG
C7Q3Y4_CATAD/293-341--FKNTRFAMG-A-A---------------------------------------FR----ESRFAGSA----S----FNG
C7Q401_CATAD/219-267--AVKVTFQGV-A-S---------------------------------------FD----EATFHALL----D----FEQ
C7QFT5_CATAD/115-163--LTDTHLYGD-S-V---------------------------------------FA----GTRFADQA---L-----FQR
C9YWN0_STRSW/346-394--FEGATFSGN-V-R---------------------------------------FS----EATFNGMT----G----FRH
C9YWN0_STRSW/412-461--FRHTTLSGT-I-D---------------------------------------YN----NATFNSTV---VD----FEN
D1A1F1_THECD/92-138--LERCHFDEV-P-D---------------------------------------LS----NARTRQL-----R----MSE
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D2BDD3_STRRD/155-203--FGAARFERA-A-S---------------------------------------FE----SAEFHGFA---T-----FDG
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PF13599

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Q0WJF6_YERPE/438-518STFINCSMLESCCDK-ADFSQATLIA-CDMTAVRLKD-----ANLVHSH-----WQ----NTSLQQSM---------FYN
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Q9CHH7_LACLA/49-124--IYRSIFKSCKLLG-TDFTESHLQD-LQFTENL----------MTYAN-----FS----GSTLKSVR---------FLE
B0N3P9_9FIRM/63-138--ITDCIFENCDLSN-LEFNKVSIHR-CHFINCKM----------TGLN-----FI----DCSLQDLL---------FEG
R5X5X1_9CLOT/132-210CEFLDCTFLNTKFKE-DEFFNFNLESIAYFSNSSF----------HNCI-----FD----KTNLRKSI---------FQQ
R7EHW0_9BACE/103-183-EFISCKLVGTNLPE-TILNHLTMKD-CNARYLNLSM-----SKINQAR-----FT----SCDLRNSD---------VND
T0VJX4_9ENTE/87-173ASFHQVHFKNCKLTG-TNFAESYFRD-CTFESCVGNF-----ASFSNTNLKTIRFA----ECQLNDTE---------FYE

PF00805

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A0B7Y5_METTP/179-218SQF---S-RA-ELYGANLT-G--T---D----LSG----
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L0GQS5_9GAMM/836-875ADL---R-DA-EMPGAWLR-R--C---D----LTG----
M4SE31_9SPHN/86-125SNL---T-SA-FFRGCKLT-G--G---D----LSD----
M4SE31_9SPHN/131-170QVL---R-KL-DLAQADLR-N--C---D----FRD----
YISX_BACSU/143-182ASF---T-GT-SLQNMDIS-T--C---R----FEQ----
YYBG_BACSU/174-213SVL---I-GA-KLKGLDLR-G--A---N----LRG----
Y1819_SYNY3/231-270TNL---T-GS-NLSFTRMN-S--A---D----LSR----
P73963_SYNY3/118-157AVF---T-EV-EAHGLRLY-R--A---K----VSQ----
Y1152_SYNY3/90-129ADL---T-KA-SLYGAFAV-K--T---N----FKG----
Y1152_SYNY3/185-224MDL---S-AL-SLHGLAMD-G--A---K----LTG----
Q03I28_PEDPA/70-109CEF---R-NC-KMLGINLN-G--A---I----FNN----
Q0ALQ7_MARMM/147-186ADF---T-DA-MLLGTRLI-R--A---N----LRG----
Q10WP6_TRIEI/67-106IQL---Y-KA-NLSNTNIQ-Q--G---H----LSR----
Q113G1_TRIEI/83-122SDL---T-NA-IFTDAMLM-S--S---T----FRD----
Q184I8_CLOD6/74-113ASF---R-FC-DLSNSDIR-G--A---N----LEN----
Q2GFB5_EHRCR/259-298VDA---H-YT-NLNNTNLH-K--V---R----MSD----
Q2JMK9_SYNJB/84-123ALG---D-YS-NFTAAKLD-K--S---S----FQG----
Q31RN7_SYNE7/33-72AML---A-QA-DLSFTDLS-N--A---N----LQG----
Q39WD6_GEOMG/72-111ANL---F-GA-NCQGANFC-N--S---S----LRG----
Q55531_SYNY3/57-96SIL---T-DA-VFLHASLR-G--A---N----LSG----
Q63K60_BURPS/281-320ATL---S-HA-DCTGADFS-H--A---N----LHG----
Q63NW6_BURPS/562-601TDF---S-GS-DLSDGIFE-Q--V---H----LRD----
Q74B06_GEOSL/107-146ADM---R-KV-NVEKGNFS-Q--A---N----LTN----
Q837D8_ENTFA/97-136CKA---D-YA-SFRFANFN-L--V---H----FNQ----
Q8DHT2_THEEB/40-79ALF---T-GA-QLEGCNFT-Q--A---I----FND----
Q8DKZ0_THEEB/100-139VDL---A-NA-DLRGLPLD-G--V---N----LSG----
Q8NPC6_CORGL/149-188CDL---S-YC-SFIGAQLG-D--T---V----ISG----
PIPB2_SALTY/287-326ADL---A-EA-NLNNTCFK-D--C---T----LTD----
Q9K676_BACHD/63-102VQF---Q-DA-IIHKAEFR-R--C---R----MTG----
Q9ZCY8_RICPR/136-175TAF---N-KS-TIINVNFE-N--S---K----FSN----
Q9ZCY8_RICPR/519-558SIL---T-GS-IFKFAQID-Q--T---C----FSN----
R5JCA5_9FIRM/26-65IKA---R-NT-SFEGASFV-E--A---S----FKG----
R6CJY4_9FIRM/60-99CDL---S-NS-AFSDCCFK-G--C---K----FRG----
R6CRW1_9CLOT/120-159CSL---E-EA-DLSEGKLK-S--V---E----FSD----
R6ZHW4_9FIRM/759-798VSF---I-NS-NLLGADFQ-N--C---I----FQN----
U4KBL8_9VIBR/57-96AQF---T-GA-NCLGTEFR-Q--C---D----MKG----
U5QJZ6_9CYAN/177-216ADL---T-NA-KLYRSCLS-R--I---N----FRD----
W0PDU8_ADVMD/278-317ADF---S-RA-NLRHTQFE-S--V---T----LRD----
W0PEX0_ADVMD/860-899QDF---T-HA-DMSMTDFS-E--S---S----LKG----
W1NDZ3_AMBTC/188-227ANL---Q-SA-NLQDACLI-H--C---S----FSG----

PF13576

B5H984_STRE2/125-173AQF--AD-GA-RFGGAQFA-HG-A---R----FSGAQ--
B5H984_STRE2/202-250ARF--AG-HV-AFAGARFV-EM-T---R----FGPVV--
A0B5U2_METTP/99-147AHF--KQ-DV-SFSGSRFL-GD-A---E----MNFTA--
A0B9T1_METTP/112-160ASF--GS-DV-SFAGAHLL-RV-A---E----FTLTK--
A0B9T1_METTP/167-215AAF--WN-CA-DFSNAQFM-DD-T---S----FERVH--
A0B9T1_METTP/233-281VSF--DE-NA-IFMGSRFS-HD-V---T----FSAAQ--
A0ZD13_NODSP/318-366AIF---EQVV-IFRDAIFN-QA-V---N----LSGAS--
A1Z8W1_DROME/753-797ATL---Q-EP-NLQDATLQ--E-L---N----LQDAT--
A2U1F0_9FLAO/177-225TKF--KD-GV-SFRNVNFE-ED-L---N----IKYMN--
E0THL3_PARBH/139-184CWF---D-NG-WFAGAAFT--S-C---V----LEKCD--
A4FAP0_SACEN/197-246VRF---TGLA-DFRRVTFD-GEGP---N----FRGTS--
A4FQH2_SACEN/233-281SRF--LG-RI-RADGAVFH-GG-L---Q----LHSCT--
A4ICH5_LEIIN/198-242ATA---R-RA-HFSHCMFH--R-A---D----LSDWD--
A6UVV6_META3/208-256NIF--EE-EI-NFTDTKFK-GR-A---D----FGGVI--
A7RX60_NEMVE/30-74ALS---T-GV-YFTGALST--G-V---Y----FTGAL--
A7SIC1_NEMVE/41-85STF---Y-ES-TFYGPTFY--G-S---T----FYGST--
A7SRL0_NEMVE/96-140VDI---R-QV-DMRKVDMR--Q-V---D----MKEVD--
A8EV36_ARCB4/203-251TTF---EKLS-IFRNSEFK-DS-I---N----LKDAI--
B0G184_DICDI/190-234SAF---I-DC-IFMNCNIN--G-C---D----FSKST--
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B0JQ65_MICAN/216-264ATF---EKSG-AFRSSYFN-GV-V---S----FQDVK--
B3U4K5_9BACT/153-201DRF---TQGA-MFSDTHFG-PH-A---R----FHRSM--
B3U4K5_9BACT/252-300ARF---GAQA-DFSDAAFK-QA-D---D----LAQAT--
B5GS14_STRCL/232-284AVFP-DG-TV-SFENALFT-GGIV---D----FRRAV--
B5GS14_STRCL/328-380AVLS-GG-VI-DFRNAVFS-GGTV---K----LARTV--
B5GW00_STRCL/88-136AVF--DG-GL-YVQDACVG-GD-L---R----LSAAQ--
B5GW00_STRCL/176-223AVV--DG-EA-AFDGVHFE-QG-A---D----FTKTR--
B5IFQ8_ACIB4/85-132SQF---D-FA-SFNGTQFK-KG-A---D----FTHSH--
B7KEX0_GLOC7/178-226AIF---EQNI-NFSEVQFF-AE-A---R----FSHTQ--
B7KEX0_GLOC7/255-303SIF--FE-SL-SLVNATFE-KS-V---A----FRATL--
B7QLD9_IXOSC/210-254CDF---M-RV-RFVDTDFY--D-Y---R----FDDCA--
B8GI24_METPE/90-138ANF--KG-DA-SFEGANFD-RF-A---G----FNRVT--
B8GI24_METPE/178-226ATF--DG-NA-SFNGVFFH-GN-V---R----FNETT--
B8GI24_METPE/244-292VTF--DG-DA-RFNKTTFD-GD-A---G----FNGAT--
B8GI24_METPE/315-362TDI--SN-DL-DLSKSTIT-GD-A---T----FKKSK--
B8HPH9_CYAP4/218-266SIF--FA-KA-SFSQCQFR-QK-A---D----FSSSE--
B8HPH9_CYAP4/295-343SSF--AQ-TV-SFRESQFN-RP-V---N----LRGVI--
B9JIK6_AGRRK/26-71CRF---E-SV-STSKADIL--D-C---E----FKACT--
C0QEU2_DESAH/556-605ADL---S-GS-TFAGTRTA--D-V---S----FVESI--
E8RMD0_ASTEC/266-314AYF---GAGV-DFREARFG-ES-V---S----FGASH--
C6BSE6_DESAD/72-120TKF--HD-IA-IFADAIFV-SD-V---E----FENSQ--
C6BSE6_DESAD/185-233AFF--KE-WA-YFRNAEFD-KE-T---S----FAGAI--
C6BYH9_DESAD/482-531CDF---N-SC-SLDESIFY--D-C---Q----LEACN--
C6C206_DESAD/124-172ARF---ESLT-EFEKSTFH-NA-C---N----FEHAI--
C6C206_DESAD/276-324AIF--HN-YS-NFEQSKFT-GI-T---H----FINTL--
C6HJW2_AJECH/566-610APF---G-NA-PFGNAPFD--N-A---P----FGNTP--
C6W9W0_ACTMD/153-201ARF--LR-HA-DLADTLFT-AD-A---D----LTGAV--
C6W9W0_ACTMD/219-267ARF--GG-RA-LFTGTTFG-HD-A---R----FDRVW--
C6WQX5_ACTMD/283-331ARF---TGDA-DFRGARFT-GG-V---V----LPTAL--
C6XQJ8_HIRBI/307-355SIF--HD-KL-HLENITFS-GT-V---N----FQFTG--
C6XWZ7_PEDHD/191-235SHI---E-GC-DFSGANFT--G-L---E----FKSGG--
C7NY76_HALMD/73-120CDI---G-GL-ELPGARFE-FD-L---E----LSDST--
C7NY76_HALMD/304-352ATF--AD-EV-DFDEARFD-GD-V---S----FEQVS--
C7PX43_CATAD/315-366AVVA-PE-RF-RFAGARFE-GATL---D----FSGAQ--
C7Q3Y4_CATAD/215-264AHFHQGN-EV-DFQGALF--GW-A---N----FDGVK--
C7Q3Y4_CATAD/293-341ATF---TKIT-HFTDAHFA-AT-T---S----FDHVT--
C7Q401_CATAD/219-267VTF--EE-YV-TFRKSTFH-GV-A---W----FSEAV--
C7QFT5_CATAD/115-163SVF--EG-DA-SFAGARFH-RA-A---D----FGRAR--
C9YWN0_STRSW/346-394TTL--SG-TI-DYNNATFN-ST-V---D----FEDAT--
C9YWN0_STRSW/412-461ATF--SG-TV-RFSEATFN-ST-A---G----FRHTT--
D1A1F1_THECD/92-138CRM---P-GL-DAGGLQAD-GY-V---S----LSRSR--
D1AHH9_SEBTE/79-128SDM---K-TA-NFKNTILF--N-T---I----FENIE--
E3J1P2_FRAIE/106-154VDF--GG-EA-WFGGATFA-QD-A---I----FRRTA--
D2AYK8_STRRD/98-144CEM---E-RV-RAARCTVN-GL-L---E----FDGST--
D2BDD3_STRRD/78-126ARF--HR-LA-SFLDASFA-GN-V---S----FREVR--
D2BDD3_STRRD/155-203ARF---TGDA-TFRGCRFG-RT-V---S----FRKAG--
D2BE49_STRRD/180-228VTF---TGTT-WFHRATFT-GE-T---W----FNKAI--
D2BE49_STRRD/267-315ATF--SE-DA-EFRDATFT-GN-A---R----FGEVT--
E3I4F4_RHOVT/72-120AEF---GLSA-TFARVHFQ-AD-A---T----FKAAK--
E3I4F4_RHOVT/157-205AQF--AA-AA-RFDEARFL-SD-T---M----FEGAV--
E3I4F4_RHOVT/223-271GQF--WN-DV-SFRDARFD-KP-A---S----FVDMR--
E3I4F4_RHOVT/278-326AEF---GAPA-IFRQSGFT-GG-V---T----FAGAR--
D2NPE7_ROTMD/372-420ATF--YG-DA-HFSRATFE-GL-A---G----FSDVT--
D2NPE8_ROTMD/321-369AIF--IR-NA-NFNGSTFT-GD-A---D----FFEAT--
D2NPE8_ROTMD/396-443TLF--IQ-NA-VFRGSVFT-HG-A---N----FNGAT--
D2NPE9_ROTMD/216-264SEF--MS-EA-HFQHAAFH-KA-A---K----FTGTI--
D2NPE9_ROTMD/351-399ARF--SG-IA-DYTETIFD-TT-S---F----FAGTI--
D2VLU0_NAEGR/92-137ENF---E-NV-TFTDCIYD-DN-C---S----FSGEK--
D2VTE4_NAEGR/532-577CDF---A-NS-NFEQAIFN-AD-N---D----TFDCN--
D3PTZ3_STANL/205-253TEF---D-AA-WFDNALFT-AV-A---R----FHDTI--
D3PWM9_STANL/650-698VSF--LD-EV-IFRDANFM-AA-A---L----FTGGS--
D3Q0R0_STANL/332-380ARF--DG-DT-RFTKARFE-GS-V---S----FSRAQ--
D3SS34_NATMM/251-299ASF--QG-EA-FFSGATFA-GG-L---N----WWNVT--
D3UFQ9_HELM1/307-353SSF---D-EI-TILKTFFD-QR-T---S----FYYAT--
D4GQ01_HALVD/130-178ATF---EQDV-RFSGATFR-GE-V---R----CDETV--
D4GQ01_HALVD/235-283VRF--NE-MA-DFDEARFD-DD-A---S----FANAR--
D4GQ01_HALVD/373-421VEF--QS-NA-RFGEARFE-ED-V---R----FNAAT--
D4GU30_HALVD/292-342ARFG-SG-PA-SFVRAAVD-GE-F---D----LSDAV--
O41162_PBCV1/24-68TTF---D-ET-TFDETTFD--E-T---T----FDETT--
Q18IW6_HALWD/139-188TTF---EQSL-VCEEITVA-VD-L---F----FEHAE--
Q18IW6_HALWD/224-271ATA--NG-TI-RLNGSTFH-AA-A---D----FDELH--
Q18IW6_HALWD/328-376TTF--AD-TA-DFDEVIFD-GD-V---A----FTNTT--
Q1GIY3_RUEST/135-183AKF---EQEA-WFHFANFQ-KA-A---L----FGRAR--
Q38YU5_LACSS/58-102VAF---D-GC-QLIGADFA--E-A---G----LRDVR--
Q3A0P8_PELCD/63-107AVM---T-DV-VFEDCEFS--D-T---S----LSGST--
Q4Q1F2_LEIMA/247-294TDW---G-RC-RRLDWVMK-PG-S---S----VRECR--
Q55EY9_DICDI/172-221TNF---S-SS-DLCGSNFT--D-S---D----LGHSS--
Y1147_METJA/157-204TTF---N-IA-EFYNSTFK-SH-V---Y----FDDIS--
Q5UWS9_HALMA/134-182TTF--HE-DV-RFSQAHFH-GR-V---D----CDEAI--
Q5UWS9_HALMA/218-265TQF--DD-DA-TFTHAIFG-DD-T---T----FATTE--
Q5UWS9_HALMA/366-414TEF--YA-DA-DFVNATFG-GP-A---T----FDEVR--
Q5V0I3_HALMA/196-240ASV---T-DA-AFDRVTIE--E-G---S----FQHAT--
Q5V0I3_HALMA/246-290AEF---G-TA-RFYGATFS--G-G---Y----FNETS--
Q5V0I3_HALMA/357-402SDI---D-QF-RAAEVTCI-GT-V---R----LHGCT--
Q6MJB4_BDEBA/115-159THF---V-DS-NLSRVDFV--S-T---R----FENCS--
Q73NC7_TREDE/53-102SDI---Q-FS-SFGGARII--R-T---D----FKNSE--
Q73UA0_MYCPA/29-73CTF---R-RT-SLWHSTFE--Q-C---T----MLGSV--
Q825J8_STRAW/123-171ASI---GGTL-HLEDSRLT-GG-A---D----LRDSS--
Q82R80_STRAW/120-168ARF--EG-DA-GFGSARFE-GD-A---S----FVSAT--
Q82R80_STRAW/296-344ATL--QS-NA-NFLGVTFE-RD-A---K----FESSI--
Q82RY0_STRAW/131-179ATF---SHGA-RFGKTTFS-CR-T---S----FDVAT--
Q82RY0_STRAW/197-244AKF--SE-DA-RFDGTTFS-RD-T---S----FQGAT--
Q8NQK5_CORGL/66-115ARSI-WR-NA-TISDSRF--GA-V---E----MYEAT--
Q8YSY0_NOSS1/116-164TQF--QE-TA-NFQRISFE-NV-A---N----FNEAQ--
Q8YSY0_NOSS1/182-230TTF---EQAV-IFREALFN-RP-V---D----LRGAS--
Q9S1T7_STRCO/95-141SWV---P-GI-NAELARIE-GD-L---D----LRRST--
A4X415_SALTO/81-125TRF---A-NV-RLKDVLFD--G-C---R----LDYAT--
D2NPE6_ROTMD/225-273AQF---TADA-SFQGANFN-DW-V---G----FSAAH--
E7FY18_ERYRH/127-171CEL---T-GL-NLSDTRCN--A-L---D----LTSCT--
YJBI_ECOLI/122-169SNL---T-AV-MFDYVRMS--T-G---N----FKDCI--
Q8FQA5_COREF/110-157ARF--NG-LA-SVQRVQFH-HT-A---R----FTDA---

PF13599

C9ABD1_ENTCA/87-174MDW---K-HL-TLQENQLN-NSNWFH-T--K-LATLD-F
Q8EA45_SHEON/101-179GSF---N-RA-NFTFSDFR-HSLFGR-T--E-LLEAD-F
Q83B86_COXBU/280-357AQL---K-AA-GFSAKDLK-SAGF-S-A-VA-LKQAG-F
Q5WCS9_BACSK/76-153ARL---K-HV-AFRQCSLE-AANF-S-D-CL-LKPVE-L
D1BEV2_SANKS/98-175VRG---T-RM-SFVGTRIA-QLTL-SRA--T-LTRAD-L
Q07ZY3_SHEFN/33-116IDW---T-KA-QWPQFMTQTTIKF-E-R--S-LLDGSNF
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Q0WJF6_YERPE/438-518ADL---R-DA-TFQRCNLA-GANL-A-MISQ-NMD----
Q5HRU9_STAEQ/60-147IIF---K-NV-SFKNVEIE-GTTF-K-D-VK-FKNCE-F
Q5LG63_BACFN/85-162VKM---R-TA-RFSHCNFR-NGSL-N-D-SK-LMPAA-F
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Q8YAP0_LISMO/88-165GAY---T-NS-DFSGAQLV-DTYL-E-R-LD-LNKAQ-F
Q9CHH7_LACLA/27-101NLM---T-YA-NFSGSTLK-SVRFLE-N--E-AKE----
Q9CHH7_LACLA/49-124NEA---K-ET-FFTACNFK-NVELLK-N--Q-LEAAN-F
B0N3P9_9FIRM/63-138VQG---R-YM-NISLGNIR-CVEF-N-D-ST-LDESS-F
R5X5X1_9CLOT/132-210NKI---K-NI-QFILCNLK-KSIF-D-K-DE-IESIY-F
R7EHW0_9BACE/103-183CKL---A-SI-AFENCELV-ESEF-S-H--TPLRGID--
T0VJX4_9ENTE/87-173VQW---K-NL-QLQHNQLT-NSNWFR-T--K-LYQLD--

This alignment is coloured according to the ClustalX colouring scheme:

 
Glycine (G)
 
Proline (P)
 
Small or hydrophobic (C,A,V,L,I,M,F,W)
 
Hydroxyl or amine amino acids (S,T,N,Q)
 
Charged amino-acids (D,E,R,K)
 
Histidine or tyrosine (H,Y)

For UniProt-based alignments, we also add some additional mark-up to the alignments where appropriate. Active site information is shown as follows:

 
Active site (residue annotated in SwissProt as an active site)
 
Predicted active site (residue aligns in a Pfam alignment with a SwissProt active site)
 
Predicted active site (residue annotated in SwissProt as a potential active site)

Some UniProt sequences can be mapped to protein structures, in which case we also show the secondary structure definition. These lines are shown below the sequence to which they apply and are marked (SS). The meaning of each of the symbols is as follows:

C
Random coil
H
Alpha-helix
G
3(10) helix
I
Pi-helix
E
Hydrogen bonded beta-strand (extended strand)
B
Residue in isolated beta-bridge
T
H-bonded turn (3-turn, 4-turn, or 5-turn)
S
Bend (five-residue bend centered at residue i)
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