# STOCKHOLM 1.0 #=GF ID ADI #=GF AC PF02274.20 #=GF DE Arginine deiminase #=GF AU Chuguransky S;0000-0002-0520-0736 #=GF GA 22.8 22.8 #=GF NC 22.7 22.7 #=GF TC 22.8 22.8 #=GF PI Amidinotransf; #=GF SE Pfam-B_5784 (release 5.2) and Pfam-B_1850 (release 5.5) #=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann #=GF SM hmmsearch -Z 61295632 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq #=GF TP Family #=GF CL CL0197 #=GF RN [1] #=GF RM 9393705 #=GF RT The arginine deiminase pathway in Rhizobium etli: DNA sequence #=GF RT analysis and functional study of the arcABC genes. #=GF RA D'Hooghe I, Vander Wauven C, Michiels J, Tricot C, de Wilde P, #=GF RA Vanderleyden J, Stalon V; #=GF RL J Bacteriol 1997;179:7403-7409. #=GF RN [2] #=GF RM 11504612 #=GF RT A novel superfamily of enzymes that catalyze the modification of #=GF RT guanidino groups. #=GF RA Shirai H, Blundell TL, Mizuguchi K; #=GF RL Trends Biochem Sci 2001;26:465-468. #=GF RN [3] #=GF RM 14675764 #=GF RT Prediction of the structure and function of AstA and AstB, the #=GF RT first two enzymes of the arginine succinyltransferase pathway of #=GF RT arginine catabolism. #=GF RA Shirai H, Mizuguchi K; #=GF RL FEBS Lett 2003;555:505-510. #=GF DR SCOP; 1jdw; fa; #=GF DR SO; 0100021; polypeptide_conserved_region; #=GF CC This family contains arginine deiminases, EC:3.5.3.6., enzymes #=GF CC that catalyse the reaction: arginine + H2O <=> citrulline + NH3. #=GF CC These enzymes belong to the amidinotranferase (AT) superfamily, #=GF CC which share the alpha/beta fold including structurally important #=GF CC residues, i.e buried hydrophobic residues, buried hydrophilic #=GF CC residues hydrogen-bonded with mainchain groups and a structural #=GF CC hallmark of three consecutive buried Gly residues near the #=GF CC C-terminus, conserved among these proteins [1-3]. #=GF SQ 421 Q2FUX7.1/37-408 -GLLFDDIPYLEVAQKEHDHFAQVL.R...E...E...GV.E..VLYLEKLA...A....E...S.IE....N....P...Q.......VR.S...EF.I.D.D.....V.LAE.............S.K.K.T.......IL.G...H..E.E..........E..IK..A...L.FAT--.....................-LSNQELV.DKI.M.S.G.VR...K...E...E....I....N.P..K.C...T..H.....L....V..E.YMD.D...K.....YPFYLD...P...MPN...L...YFTRDPQASIGHGIT.I.NRMFWRARRR.E.....S.IF...I.QYI..VKH...HP...R...F..........KD..........A.N..........I..........P..........I.........W.LD...............R.......D.......C........-.....-........-...-P.........FN....IEGGDELVLSKD...VLAIG.VS.E.RT..SAQAIEK.LAR..RIFENp.....qATFKKVVA...I.E.....I.P...T...S...R...T........F..MHLDT.......VFTMIDYDK.FT.M.H.S.A.IL.KAEG.NMNIFII.EYDD................................VNKDI.AI.K.Q.SSHLKDTLEDV..........................L..G..I.D.DI......QF..IPTG..........N..GD..vIDGAREQ...WNDGSNTLCI...R.....PG..V.....V.VTYD..RN...Y..V.SN.D.LLRQK.............................................GI.K..V.IEISGSE......LV.R.GRGGPRCMSQPLFR P13981.2/38-413 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-DLLFDDIPYLELAQKEHDRFADLL.R...S...R...GV.E..VLYLDQLA...A....E...A.LT....N....D...A.......VR.R...KF.V.D.D.....M.LRA.............S.K.Q.G.......GR.R...V..S.E..........A..LT..S...Y.LLAM-.....................-EPRQMVR.KIM.A.G.V.RK...D...E...I....Vl.ppE.H..D.Q...Q..L.....H....D..M.LEQ.D...H.....YPFYLD...P...MPN...L...YFTRDPGAAIGNGLT.I.NKMHWPARRR.E.....S.LF...L.RYI..IDY...HP...R...F..........AN..........Q.G..........L..........P..........V.........W.YN...............R.......T.......E........-.....-........-...-K.........FS....MEGGDELILNKE...AMAIG.IS.E.RT..TPEAIES.MAT..KLFAG.......SEFKKVIA...L.E.....I.P...K...S...H...A........F..MHLDT.......VFTMIDHDK.FT.I.H.P.E.IR.DVNG.HLNIFVL.EKVE................................GQHYP.KI.T.K.ERDLEHVLRTA..........................L..G..L.P.QI......TL..IECG..........G..GD..pIASAREQ...WNDGSNTLAI...A.....PG..V.....V.VTYD..RN...Y..V.TN.Q.KLREA.............................................GV.E..V.LEISGSE......LG.R.GRGGPRCMSMPIYR A0A4R7PK69.1/40-412 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