# STOCKHOLM 1.0 #=GF ID ADI #=GF AC PF02274.20 #=GF DE Arginine deiminase #=GF AU Chuguransky S;0000-0002-0520-0736 #=GF GA 22.8 22.8 #=GF NC 22.7 22.7 #=GF TC 22.8 22.8 #=GF PI Amidinotransf; #=GF SE Pfam-B_5784 (release 5.2) and Pfam-B_1850 (release 5.5) #=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann #=GF SM hmmsearch -Z 61295632 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq #=GF TP Family #=GF CL CL0197 #=GF RN [1] #=GF RM 9393705 #=GF RT The arginine deiminase pathway in Rhizobium etli: DNA sequence #=GF RT analysis and functional study of the arcABC genes. #=GF RA D'Hooghe I, Vander Wauven C, Michiels J, Tricot C, de Wilde P, #=GF RA Vanderleyden J, Stalon V; #=GF RL J Bacteriol 1997;179:7403-7409. #=GF RN [2] #=GF RM 11504612 #=GF RT A novel superfamily of enzymes that catalyze the modification of #=GF RT guanidino groups. #=GF RA Shirai H, Blundell TL, Mizuguchi K; #=GF RL Trends Biochem Sci 2001;26:465-468. #=GF RN [3] #=GF RM 14675764 #=GF RT Prediction of the structure and function of AstA and AstB, the #=GF RT first two enzymes of the arginine succinyltransferase pathway of #=GF RT arginine catabolism. #=GF RA Shirai H, Mizuguchi K; #=GF RL FEBS Lett 2003;555:505-510. #=GF DR SCOP; 1jdw; fa; #=GF DR SO; 0100021; polypeptide_conserved_region; #=GF CC This family contains arginine deiminases, EC:3.5.3.6., enzymes #=GF CC that catalyse the reaction: arginine + H2O <=> citrulline + NH3. #=GF CC These enzymes belong to the amidinotranferase (AT) superfamily, #=GF CC which share the alpha/beta fold including structurally important #=GF CC residues, i.e buried hydrophobic residues, buried hydrophilic #=GF CC residues hydrogen-bonded with mainchain groups and a structural #=GF CC hallmark of three consecutive buried Gly residues near the #=GF CC C-terminus, conserved among these proteins [1-3]. #=GF SQ 3775 Q2FUX7.1/37-408 -GLLFDDIPYLEVAQ.KEHDHFAQVL...........R...E...E...GV.E..VLYLEK.LA...A....E...S..IE....N....P.........Q.......V.R.S...E.F.I.D..D.....V...L......A.E.............S.....K.K..T.......I.L..G...H........E.E..........E..I.K..A...L.FA.T.--.....................-LSNQEL.....V.D.K.I.M.S.G..V.....R....K...E.....E....I.......N.....P..K....C...T....H......L.....V...E.....Y....M.....D....D...K.....Y.....PFY...L.D...P....M...P...N...L...YFTRDPQA...SIGHG............IT.I.NRM......FW.RARR.R.E.....S.....I.....F...I.Q.....Y.I.....VKH...H..P.....R.....F............K............D.................A..........N...........I.................P..........I..........W...........L............D...............R..........D..........C..........-..........-........-..........-...P.........F.N.......IEG.GDEL....VL....S...K.D...V......L.AIG..........V..........S..........E.........R....T..S.A....QA.I.....EK.LAR..R...I...FENp.............qATF.K..KV......V.....A...I.....E......I........P........T.....S.......R........T..............F..........M........HLDT.......VFT.MID.......Y.D.K..FT.M....H....S.A...I......L...K......A......E.....G......N.M...N...I...F...I....I.E.YDD...................................VNK..D..I..A..I.K...Q.S..S.H.LKD....TLEDV................................L..G..I..D..D.I......QF..I..P.T..G..........N......G.D..vID.G.....A.R............EQ...W..N.DG....SNTLCI...R.....PG..V.....V.V.........T...Y....D..R..N...Y....V..........S....N.D...LL.RQK.............................................GI..K..V....I....EISGSE......L...V.R.GR.GGPRCMSQPLFR 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P13981.2/38-413 DELLFDDVIWVNQAK.RDHFDFVTKM...........R...E...R...GI.D..VLEMHN.LL...T....E...T..IQ....N....P.........E.......A.L.K...W.I.L.D..R.....K...I......T.A.............D.....S.V..G.......L.G..L...T........S.E..........L..R.S..W...L.ES.L.EP.....................RKLAEYL.....I.G.G.V.A.A.D..D.....L....P...A.....S....E.......G.....A..N....I...L....K......M.....Y...R.....E....Y.....L....G...H.....S.....SFL...L.P...P....L...P...N...T...QFTRDTTC...WIYGG............VT.L.NPM......YW.PARR.Q.E.....T.....L.....L...T.T.....A.I.....YKF...H..P.....E.....F............A............N.................A..........E...........F.................E..........I..........W...........Y............G...............D..........P..........D..........K..........D........H..........G...S.........S.T.......LEG.GDVM....PI....G...N.G...V......V.LIG..........M..........G..........E.........R....S..S.R....QA.I.....GQ.VAQ..S...L...FAK...............GAA.E..RV......I.....V...A.....G......L........P........K.....S.......R........A..............A..........M........HLDT.......VFS.FCD.......R.D.L..VT.V....F....P.E...V......V...-......K......E.....I......V.P...F...S...L...R....P.D.PSS...................................PYG..M..N..I..R.R...E.E..K.T.FLE....VVAES................................L..G..L..K..K.L......RV..V..E.T..G..........G......N.S...FA.A.....E.R............EQ...W..D.DG....NNVVCL...E.....PG..V.....V.V.........G...Y....D..R..N...T....Y..........T....N.T...LL.RKA.............................................GV..E..V....I....TISASE......L...G.R.GR.GGGHCMTCPIVR 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W1W0S9.1/37-408 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A0A398BEX3.1/36-407 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A0A1I5W8F7.1/173-439 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A0A1I3ARF0.1/171-439 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J2L5G9.1/37-410 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