# STOCKHOLM 1.0 #=GF ID ADI #=GF AC PF02274.20 #=GF DE Arginine deiminase #=GF AU Chuguransky S;0000-0002-0520-0736 #=GF GA 22.8 22.8 #=GF NC 22.7 22.7 #=GF TC 22.8 22.8 #=GF PI Amidinotransf; #=GF SE Pfam-B_5784 (release 5.2) and Pfam-B_1850 (release 5.5) #=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann #=GF SM hmmsearch -Z 61295632 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq #=GF TP Family #=GF CL CL0197 #=GF RN [1] #=GF RM 9393705 #=GF RT The arginine deiminase pathway in Rhizobium etli: DNA sequence #=GF RT analysis and functional study of the arcABC genes. #=GF RA D'Hooghe I, Vander Wauven C, Michiels J, Tricot C, de Wilde P, #=GF RA Vanderleyden J, Stalon V; #=GF RL J Bacteriol 1997;179:7403-7409. #=GF RN [2] #=GF RM 11504612 #=GF RT A novel superfamily of enzymes that catalyze the modification of #=GF RT guanidino groups. #=GF RA Shirai H, Blundell TL, Mizuguchi K; #=GF RL Trends Biochem Sci 2001;26:465-468. #=GF RN [3] #=GF RM 14675764 #=GF RT Prediction of the structure and function of AstA and AstB, the #=GF RT first two enzymes of the arginine succinyltransferase pathway of #=GF RT arginine catabolism. #=GF RA Shirai H, Mizuguchi K; #=GF RL FEBS Lett 2003;555:505-510. #=GF DR SCOP; 1jdw; fa; #=GF DR SO; 0100021; polypeptide_conserved_region; #=GF CC This family contains arginine deiminases, EC:3.5.3.6., enzymes #=GF CC that catalyse the reaction: arginine + H2O <=> citrulline + NH3. #=GF CC These enzymes belong to the amidinotranferase (AT) superfamily, #=GF CC which share the alpha/beta fold including structurally important #=GF CC residues, i.e buried hydrophobic residues, buried hydrophilic #=GF CC residues hydrogen-bonded with mainchain groups and a structural #=GF CC hallmark of three consecutive buried Gly residues near the #=GF CC C-terminus, conserved among these proteins [1-3]. #=GF SQ 6699 Q2FUX7.1/37-408 -GLLFDDIPYLEVAQ.KEHDHFAQVL...........R.....E...E...GV.E..VLYLEK.LA...A....E...S..IE....N....P.........Q.......V.R.S...E..F.I.D..D.....V...L......A.E.............S.....K..K..T.......I.L..G...H........E.E..........E..I.K..A...L.FA.T.--.....................-LSNQEL.....V.D.K.I....M..S.G.....V.....R....K...E.....E....I.......N.....P...K....C....T....H......L.....V...E.....Y....M.....D....D...K.....Y.....P.F...Y...L.D...P....M...P...N...L...YFTRDPQA...SI...G...HG............I..T.I.N.RM.......FW.RARR.R.E.....S.....I.....F...I.Q.....Y.I.....V...K.H...H..P.....R.....F............K............D.................A...........N...........I.................P..................I..........W...........L............D...............R..........D..........C..........-..........-........-..........-...P.........F..N.......IEG.GDEL....VL....S...K.....D...V......L.A...IG..........V..........S..........E..........R....T..S.A....QA.I.....EK.L.A..R..R...I...FENp.............qATF.K..KV......V.....A...I.....E......I........P........T.....S.......R..........T..............F..........M........HLDT.......VFT.MID.......Y.D.K..FT.M....H....S.A...I......L......K......A......E.....G......N...M......N...I...F...I....I.E.Y.DD...................................VNK..D..I..A..I.K...Q.S..S.H.LKD....TLEDV................................L..G..I...D..D.I......QF..I..P.T..G..........N......G.D..vID.G.....A.R............EQ...W..N..DG....SNTLC...I...R.....PG..V.....V.V.........T...Y....D..R..N.........Y....V..........S....N.D...LL.RQK.............................................GI..K..V....I....EISGSE......L...V.R.GR.GGPRCMSQPLFR 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C2W3I0.1/36-407 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Q3XZA0.1/35-405 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A0A0M0HL76.1/34-403 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V6T4L0.1/36-407 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