# STOCKHOLM 1.0 #=GF ID PAD #=GF AC PF03068.18 #=GF DE Protein-arginine deiminase (PAD) #=GF AU Mifsud W;0000-0002-9805-6461 #=GF GA 25.0 25.0 #=GF NC 24.6 24.5 #=GF TC 25.1 25.1 #=GF SE Pfam-B_2195 (release 6.4) #=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann #=GF SM hmmsearch -Z 61295632 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq #=GF TP Family #=GF CL CL0197 #=GF RN [1] #=GF RM 9129218 #=GF RT Peptidylarginine deiminase of the hair follicle: #=GF RT characterization, localization, and function in keratinizing #=GF RT tissues. #=GF RA Rogers G, Winter B, McLaughlan C, Powell B, Nesci T; #=GF RL J Invest Dermatol 1997;108:700-707. #=GF RN [2] #=GF RM 11166924 #=GF RT Protein deimination in the rat brain after kainate #=GF RT administration: citrulline-containing proteins as a novel marker #=GF RT of neurodegeneration. #=GF RA Asaga H, Ishigami A; #=GF RL Neurosci Lett 2001;299:5-8. #=GF RN [3] #=GF RM 10092850 #=GF RT Molecular cloning of cDNAs of mouse peptidylarginine deiminase #=GF RT type I, type III and type IV, and the expression pattern of type #=GF RT I in mouse. #=GF RA Rus'd AA, Ikejiri Y, Ono H, Yonekawa T, Shiraiwa M, Kawada A, #=GF RA Takahara H; #=GF RL Eur J Biochem 1999;259:660-669. #=GF DR INTERPRO; IPR013530; #=GF DR SO; 0100021; polypeptide_conserved_region; #=GF CC Members of this family are found in mammals. In the presence of #=GF CC calcium ions, PAD enzymes EC:3.5.3.15 catalyse the #=GF CC post-translational modification reaction responsible for the #=GF CC formation of citrulline residues: Protein L-arginine + H2O <=> #=GF CC Protein L-citrulline + NH3. Several types are recognised (and #=GF CC included in the family) on the basis of molecular mass, #=GF CC substrate specificity, and tissue localisation. The expression #=GF CC of type I PAD is known to be under the control of oestrogen [3]. #=GF SQ 468 A0A7J7FAH3.1/348-723 VFQDSVAFRVAPWIMTPNTQPPKEV.....YV.CRILEN............----E.........................................................DFL..KSVTALAK.KAR........C.QLTICSEE...ES...M....D....D............QW.MQDEMEVGYVQ.APHK-T...........LPV.V....FDSPR..................NRGL..KE......FPLKCVR....G.PDFGYV........TRG.P.Q..T..EEITDLDSFGNLEVSPPV..TV..GGKEYP..LGRILIGN--C.SYPs....................eESQEMHQALQDFL..IAQ..Q..VQ..AP.V.KL.YSDWLFVGHVDEFLSFVPAH..............K-....KGF.RLLLASPRSCYKLF.........................................................................QEQL..KEGHG.DXXXXKGI--................................--AKKKQQKIKDILS....NKK..L..REHNSY..............V......ESC.I.DWNREVLKREL..G...L....T..ERDIIDIPQLFKL-...................................-QQDSSGTFK..........................................................................AEAYFPNMVNML....VL.......GK.......NL.GI.PKPFG.P..I...V.N.GR......C.CLEEK..VRSLLE..P.........L.........G..L.H.CTF..IDDF.G.TYH...V..R.HGEVHCGTNVRRQ.P.F..S.F---- A0A7J7FAH3.1/1043-1440 VYKDTVVFRVAPCIFIPSTQMPLEV.....YL.CRELQV............----Q.........................................................GFV..NTVMELSE.RSD........S.QVASVYED...PN...R....L....G............RW.LQDEMAFCYTQ.APHK-T...........ISL.V....LDTPR..................VLKL..ED......FPMKYSL....S.PGVGYV........IQC.T.K..D..HRVASMDSIGNLMVSPPV..KV..GGKEYP..LGRILIGS--S.FYPs....................kEGRNMSKALRGFL..YAQ..Q..VQ..AP.V.EL.FSDWLMIGHIDEFMCFIPTQdk..........reGD....KGF.LLLLASPSSCYQLF.........................................................................QEKQ..KEGYG.DMPLFEEVRTd.............................qlLSNAREAKTIHQLLA....DED..M..RKQNDY..............V......QKC.I.NLNRDILKKEL..G...L....V..ERDIIDIPQLFCLEql..............................tnaPSDQQTGKLF..........................................................................ARPFFPNLLQTI....VM.......GK.......NL.GI.PKPFG.P..R...V.K.GT......C.CLEEK..IRQLLE..P.........L.........G..C.H.CTF..INDF.D.CYL...T..E.IGDFCACANIRRV.P.F..A.FKWW- T0MHA5.1/314-693 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LFTDSVAFRVAPWIMTPNTQPPLEL.....YV.CRVIDS............HGSND.........................................................KFL..GDVSDLAL.KAN........C.KLIICPWT...EN...R....N....D............RW.IQDEMEFGYIE.APHK-S...........FPV.V....FDSPR..................DRGL..KD......FPYERIL....G.PDFGYV........TRE.I.L..L..SGASGLDSFGNLDVSPPV..TV..GGKEYP..LGRILIGSNFP.KS-......................GGRRMARVVRDFL..SAQ..Q..VQ..AP.V.EL.YSDWLSVGHVDEFLSFVPAS..............DQ....KGF.RLLLASPSACLQLF.........................................................................QEKK..EQGYG.DAAQFDGL--................................--KHQAKRSINEMLA....DRR..L..QKDSLH..............V......QSC.I.DWNREVLXXXX..G...L....T..ERDIIDIPQLFSL-...................................------KGSY..........................................................................AEASFPDMVSALeggwAI......sRQ.......HG.GLrQAPGH.P..QalrA.H.HR......R.PLLPX..XXXLLE..P.........L.........G..L.H.CTF..IDDY.L.SYH...K..L.LGEVHCGTNVRRQ.P.F..S.FKWWN A0A7J7F9L2.1/1025-1286 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