# STOCKHOLM 1.0 #=GF ID PAD #=GF AC PF03068.18 #=GF DE Protein-arginine deiminase (PAD) #=GF AU Mifsud W;0000-0002-9805-6461 #=GF SE Pfam-B_2195 (release 6.4) #=GF GA 25.00 25.00; #=GF TC 25.10 25.10; #=GF NC 24.60 24.50; #=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann #=GF SM hmmsearch -Z 61295632 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq #=GF TP Family #=GF CL CL0197 #=GF RN [1] #=GF RM 9129218 #=GF RT Peptidylarginine deiminase of the hair follicle: #=GF RT characterization, localization, and function in keratinizing #=GF RT tissues. #=GF RA Rogers G, Winter B, McLaughlan C, Powell B, Nesci T; #=GF RL J Invest Dermatol 1997;108:700-707. #=GF RN [2] #=GF RM 11166924 #=GF RT Protein deimination in the rat brain after kainate #=GF RT administration: citrulline-containing proteins as a novel marker #=GF RT of neurodegeneration. #=GF RA Asaga H, Ishigami A; #=GF RL Neurosci Lett 2001;299:5-8. #=GF RN [3] #=GF RM 10092850 #=GF RT Molecular cloning of cDNAs of mouse peptidylarginine deiminase #=GF RT type I, type III and type IV, and the expression pattern of type #=GF RT I in mouse. #=GF RA Rus'd AA, Ikejiri Y, Ono H, Yonekawa T, Shiraiwa M, Kawada A, #=GF RA Takahara H; #=GF RL Eur J Biochem 1999;259:660-669. #=GF DR INTERPRO; IPR013530; #=GF DR SO; 0100021; polypeptide_conserved_region; #=GF CC Members of this family are found in mammals. In the presence of #=GF CC calcium ions, PAD enzymes EC:3.5.3.15 catalyse the #=GF CC post-translational modification reaction responsible for the #=GF CC formation of citrulline residues: Protein L-arginine + H2O <=> #=GF CC Protein L-citrulline + NH3. Several types are recognised (and #=GF CC included in the family) on the basis of molecular mass, #=GF CC substrate specificity, and tissue localisation. The expression #=GF CC of type I PAD is known to be under the control of oestrogen [3]. #=GF SQ 3215 A0A7J7FAH3.1/348-723 -VFQDSVAFRVAPWIMTPNTQ....PPKEV.....YV.CRILEN...............----E.............................................................DFL..KS....VT.A......LAK.KAR........C.QL..T.I..C...SE..E.....E....S....M......D....D.............QW.M............QD.....E.MEVGY.V..Q.APHK-T...........LPV.V....FDSPR..............................NR.G..L...K...E......FPLKC..VR....G............P..D...FG.YV..............TR.G.P.Q..T..E.E...ITDL.D.SFGNLEVSPPV..TV..G....G....KE..YP..LGRI...LI.....GN.-.-.C.SYPs....................eESQEMH..QALQDFL..IAQ..Q..V..Q.....AP.V..K.L.YSDWL.FV.G.HVDEFLSF..VPAH...........................K-....K.....G.F...RLLLASPRSCYKLF............................................................................................QEQ.L....KE.....G.HG...DXXX.XKGI--.......................................................--AKKKQQKIK..D.I.....L.......S........N................K..K..L....R.EHN.....S.Y..............V......E.S.C.I.........D.......WNREV.......LK....REL......G.....L.....T..E......R...D......I......ID.I.....PQLFKL-.........................................-QQ.DS.SG..TFK....................................................................................AEAY.FP.NM...VNML....VL.......GK.......NL.G.I.PKPF......G.P..I..........V................N........G..R......C.C...LE...EK..VRSL.........L..E..P.........L.........G.....L...H...C..TF..IDDF.G.TYH...V..R.....HGEVHC..GTNVR.R.Q.P.F...S...F...-.--- 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