# STOCKHOLM 1.0 #=GF ID PilS #=GF AC PF08805.14 #=GF DE PilS N terminal #=GF AU Mistry J;0000-0003-2479-5322 #=GF GA 22.0 22.0 #=GF NC 21.6 21.8 #=GF TC 22.1 22.0 #=GF SE pdb_1q5f #=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann #=GF SM hmmsearch -Z 61295632 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq #=GF TP Domain #=GF CL CL0327 #=GF RN [1] #=GF RM 14500527 #=GF RT The type IVB pili of Salmonella enterica serovar Typhi bind to #=GF RT the cystic fibrosis transmembrane conductance regulator. #=GF RA Tsui IS, Yip CM, Hackett J, Morris C; #=GF RL Infect Immun. 2003;71:6049-6050. #=GF RN [2] #=GF RM 15159389 #=GF RT NMR structure of a type IVb pilin from Salmonella typhi and its #=GF RT assembly into pilus. #=GF RA Xu XF, Tan YW, Lam L, Hackett J, Zhang M, Mok YK; #=GF RL J Biol Chem. 2004;279:31599-31605. #=GF DR INTERPRO; IPR014911; #=GF DR SCOP; 1q5f; fa; #=GF DR SO; 0000417; polypeptide_domain; #=GF CC Type IV pili are bacterial virulence-associated adhesins that #=GF CC promote bacterial attachment to host cells. In Salmonella #=GF CC typhi, the structural pilin protein PilS interacts with the #=GF CC cystic fibrosis transmembrane conductance regulator [1]. #=GF CC Mutagenesis studies suggest that residues on an alpha-beta loop #=GF CC and the C terminal disulphide-bonded region of PilS might be #=GF CC involved in binding specificity of the pilus [2]. #=GF SQ 217 Q7N7Q2.1/50-199 KDAVVETTNLQTIISST.Q.GL..MK.....GS..GG.Yef...........shAD.KMTGV...LIQ...LGGVP...KS...MTV.....RGDttv..gnaTLWNTW.G..G...Q.V.K.VG.PSS....TGGFNN..GFTVTY..ERV...PQ.SACVSL...AT....G....M....SRGG.sASEIT.I...NNT.......................HH.A.D.....G....-.....-.....K.V.T...L...E..S.AS........TACTRNng.rtGTNKLIFTIN Q7MB48.1/47-189 SEISTESSNITQMAANL.K.SI..KN.....GA..KG.Y...............DS.LDNKI...AIN...YKVVP...TN...MTQd...gKSG........IIFNSW.N..G...K.V.T.IS.PG-....--DTTA.qTFKIEY..QNV...PD.EACQQL...SL....K....L....RVAG..WSKMT.V...GGGggk.................gqqSA.T.E.....I....K.....S.....D.S.T...L...A..Q.IE........AACNAN.....DANTVTLVSA Q6D6L5.1/43-184 QRAEAEVKNIALIQAGT.K.SL..YS.....AV..SS.Y...............SG.LAITT...LVK...AKVLP...ES...IQK.....TSGa.....asSMVNVW.K..G...N.I.S.VS.SADt..gPSGAIG.sSFIITY..RSV...PA.VECAKL...VS....S....L....SAS-..FYSIE.I...GAD.......................TV.K.D.....S....N.....G.....S.L.D...I...A..G.VT........SSCSRG....gENNTVSFTS- Q6D9S5.1/58-200 YQNSATQTEVTTMLEQS.R.K-..LK.....SR..AG.Y...............TG.ASMAT...LRA...VNGIP...TS...VDR.....TGD........IYYNRY.G..G...T.Y.S.LA.PARt..nGSAFNN..SVSLTL..TGV...SE.GGCGDL...SQ....M....F....LNAGesIYSVT.I...GST.......................AM.V.T.....A....N.....V.....T.T.G...T...S..T.AAtm....igTQCDGG.....-DKTVIITTS A0A376C414.1/54-203 ANVATETANIQTIITSA.Q.SL..LK.....GS..DG.Ytf...........tsSA.KMTGA...LIQ...MGVIP...SG...MTV.....QGDkts..gtaTLYNAW.G..G...A.V.T.VA.PAS....TSGFNN..GFTVTY..DKV...PQ.DACIQI...AT....R....I....SKTG.lTNGIT.L...NNT.......................AH.S.D.....G....-.....-.....K.V.T...T...E..E.AS........TQCKADng.stGTNKLIFTIN Q63JW9.1/56-184 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