# STOCKHOLM 1.0 #=GF ID DUF1833 #=GF AC PF08875.14 #=GF DE Domain of unknown function (DUF1833) #=GF AU Bateman A;0000-0002-6982-4660 #=GF GA 21.0 21.0 #=GF NC 20.9 20.6 #=GF TC 21.0 21.0 #=GF SE PSI2 target BIG_61 #=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann #=GF SM hmmsearch -Z 61295632 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq #=GF TP Family #=GF WK Domain_of_unknown_function #=GF CL CL0249 #=GF RN [1] #=GF RM 16859499 #=GF RT The prokaryotic antecedents of the ubiquitin-signaling system #=GF RT and the early evolution of ubiquitin-like beta-grasp domains. #=GF RA Iyer LM, Burroughs AM, Aravind L; #=GF RL Genome Biol. 2006;7:R60. #=GF DR INTERPRO; IPR014974; #=GF DR SO; 0100021; polypeptide_conserved_region; #=GF CC This family of proteins are functionally uncharacterised and are #=GF CC predicted to adopt an all-beta fold [1]. They are often found #=GF CC in gene neighborhoods containing genes for an NlpC peptidase and #=GF CC a Ubiquitin domain predicted to be involved in tail assembly #=GF CC [1]. #=GF SQ 410 V6F5D3.1/9-164 ALKEAFASAPAG.T.VILDT.LEIWHP.....T.F......D......E......P......IRVV.R.D.H..A.D....L.TA..RL.EAgap............................rdgGK.RVTFAALA..FEFSPP..PV.D.T.APVP.EI.TVTLDNV.GSD.....ITD...A..LE...GA..A....V...S...Q....Q...V........I....E....IT...WRP.....Y..L.S.....T...D...........LN.GP....H.....M......D...P...P.I........T....MTLTDVEAD.T.MRV...T.GRA.R.M.L.DA.GNKSFPSITY A0A0C2UFW0.1/9-164 ALKEAFASAPAG.T.VILDT.LEIWHP.....T.F......D......E......P......IRVV.R.D.H..A.D....L.TA..RL.ETgap............................rdgGK.RVTFAALA..FEFSPP..PV.D.T.APVP.EI.TVTLDNV.GSD.....ITD...A..LE...GA..A....I...S...Q....Q...V........I....E....IT...WRP.....Y..L.S.....T...D...........LN.GP....H.....M......D...P...P.I........T....MTLTEVEAD.T.MRV...T.GRA.R.M.L.DA.GNKSFPSITY A0A178MTB5.1/9-164 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