# STOCKHOLM 1.0 #=GF ID Flavodoxin_4 #=GF AC PF12682.10 #=GF DE Flavodoxin #=GF AU Mistry J;0000-0003-2479-5322 #=GF GA 24.0 24.0 #=GF NC 23.8 23.9 #=GF TC 24.0 24.0 #=GF SE Manual #=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann #=GF SM hmmsearch -Z 61295632 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq #=GF TP Domain #=GF CL CL0042 #=GF DR INTERPRO; IPR008254; #=GF DR SO; 0000417; polypeptide_domain; #=GF CC This is a family of flavodoxins. Flavodoxins are electron #=GF CC transfer proteins that carry a molecule of non-covalently bound #=GF CC FMN. #=GF SQ 1090 A0A3A9F9Z6.1/4-157 KILVAYFS...........A...S...........G...........V.....TAKAAEKLA.E.A....A..Q..AD..L..YEIKP............K...I...PY..T...R...A..D...L...D..W.T..............D.K..K.S.....R.S...S.....V...E.M..N....D..K.A..S......R..P...A..I..A...G...K...V..E..N..M..E...........E...YDTVFIGFPIW.W.Y.V.APTIINT.FL..E..S..Y....H..F.S..G.K...T..IIPFAT...S.G.G...S..G...M.GR......T..NENL...K.P.......S.C..P.G..A.V.L.M.P.....G...K.M..L....N.G...S...L.......S...E.......T.......E...LKNWVEN- A0A3A9C7I9.1/4-158 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KVLVAYFS...........A...T...........G...........T.....TEGVAKHIA.N.G....L..N..AE..L..YEIVP............E...Q...PY..S...S...A..D...L...D..W.N..............D.N..D.S.....R.S...T.....I...E.M..N....D..P.N..A......R..P...D..I..S...G...S...V..E..N..M..E...........Q...YDVVFIGYPIW.W.Y.D.APRIVST.FM..E..S..Y....D..F.S..G.K...T..IVPFCT...S.G.G...S..G...I.GS......S..ASNL...E.K.......L.T..S.N..A.E.W.L.D.....G...Q.R..L....N.G...S...D.......S...Q.......D.......T...VMEWVN-- R9MNK5.1/4-155 -TLVAYFS...........A...S...........G...........T.....TERLAKRLA.A.A....I..G..AD..L..YEIEP............E...I...PY..T...A...K..D...L...D..W.M..............D.K..K.S.....R.S...S.....V...E.M..R....D..K.S..F......R..P...A..V..A...G...D...V..W..D..M..G...........E...YDTIFVAFPIW.W.Y.V.APTIVNT.FL..E..Q..H....D..L.R..G.K...K..IITLAT...S.G.G...S..G...M.GN......T..NKEL...A.P.......S.C..P.G..A.E.L.K.E.....G...K.V..F....S.A...D...T.......G...E.......D.......V...LRRWAE-- A0A3E2XS98.1/4-155 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KVLVAYFS...........A...S...........G...........V.....TAKLAKRLA.E.A....I..G..AD..L..HEIQP............E...V...PY..T...D...A..D...L...N..W.M..............N.K..K.S.....R.S...S.....V...E.M..N....D..K.S..F......R..P...A..V..A...N...K...V..E..N..M..E...........Q...YSVIFTAFPIW.W.Y.V.APTIVNT.FL..E..Q..Y....D..L.S..G.K...M..IIPLAT...S.G.S...S..G...M.GN......T..NKEL...A.V.......S.C..P.G..A.K.L.K.E.....G...K.R..F....P.A...D...A.......S...A.......E.......E...LKIW---- A0A1I1Z9D5.1/3-153 KTLVAYFS...........A...S...........G...........T.....TAKVAKKMA.E.A....I..G..AD..L..FEIKP............E...T...PY..T...G...A..D...L...N..W.Q..............N.K..N.S.....R.S...S.....V...E.M..N....D..R.S..S......R..P...A..I..A...V...K...A..A..D..M..P...........Q...YDVVFVGFPVW.W.Y.R.EPSIIDT.FM..E..S..Y....D..F.A..G.K...T..VIPFAT...S.G.G...S..G...L.GD......S..AANM...Q.K.......L.A..K.G..A.K.V.V.N.....G...K.R..F....S.G...S...V.......S...S.......E.......E...LKAW---- C7N7F2.1/3-154 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KILVAYFS...........A...S...........G...........Q.....TAKLAKTLA.G.V....T..G..GD..L..FEIAP............E...T...AY..T...A...A..D...L...D..W.M..............D.K..K.S.....R.S...T.....I...E.M..K....D..P.K..S......R..P...A..I..A...G...K...V..A..D..M..A...........Q...YDTVFVGFPIW.W.Y.Q.APRIIET.FL..E..S..Y....D..F.S..G.K...T..VIPFAT...S.G.G...S..G...M.GG......-..EDVL...R.S.......AcS..K.G..T.K.W.L.P.....G...K.R..L....S.S...R...E.......S...M.......A.......S...VQKWVES- A0A1H4E1E0.1/5-156 -ILVTYFS...........A...S...........G...........V.....TAKAARQIA.E.T....A..Q..AD..L..FEILP............E...T...PY..T...P...A..D...L...D..W.Q..............N.K..N.S.....R.S...S.....Q...E.M..T....N..K.G..F......R..P...P..I..A...K...H...L..A..N..L..E...........N...YDTIFLGFPIW.W.Y.V.APTIINT.FL..E..S..Y....D..F.T..G.K...T..VIPFAT...S.G.G...S..G...F.GK......T..MEGL...K.A.......S.C..S.D.kT.L.W.R.P.....G...K.L..L....N.G...A...S.......E...K.......-.......A...ITHWLD-- F7KP92.1/3-155 KVLVAYFS...........A...S...........G...........V.....TAKLAKRLA.E.A....I..G..AD..L..HEIQP............E...V...PY..T...D...A..D...L...D..W.M..............N.K..R.S.....R.S...S.....A...E.M..N....D..K.S..F......R..P...A..V..A...N...K...V..E..N..M..E...........Q...YSVIFTAFPIW.W.Y.V.APTIVNT.FM..E..Q..Y....D..L.S..G.K...T..IIPLAT...S.G.S...S..G...M.GN......T..NKEL...A.V.......S.C..P.G..A.E.L.K.E.....G...K.R..F....S.A...D...A.......S...A.......E.......E...LKTWAE-- A6P208.1/13-163 --LVAYFS...........A...T...........G...........T.....TAKAAKALA.N.A....V..G..GD..L..YEIKP............A...V...PY..T...I...A..D...L...N..W.M..............D.K..G.S.....R.S...S.....V...E.M..K....D..T.S..S......R..P...A..L..S...D...T...G..A..P..V..A...........G...HDVIFLGFPVW.W.Y.V.APTILNT.FL..E..A..Y....D..F.T..G.K...T..IVLFAT...S.G.G...S..G...L.GK......S..AAGL...R.S.......S.A..P.G..A.K.I.V.D.....G...R.M..L....N.G...R...L.......N...E.......A.......E...LKAWAE-- R5YCY4.1/3-153 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KTLVAYFS...........A...S...........G...........V.....TKKLAQTLA.D.A....I..G..AD..L..FAIEP............K...V...PY..T...R...A..D...L...N..W.M..............D.K..Q.S.....R.S...T.....I...E.M..Q....N..P.A..S......R..P...E..I..A...G...T...C..A..N..I..A...........D...YDTVFVGFPIW.W.Y.V.APTIVNT.FL..E..S..C....D..L.T..G.R...T..VVPFAT...S.G.G...S..G...M.GG......T..NKAL...A.P.......S.C..T.G..A.R.L.L.E.....G...K.V..F....R.S...S...T.......N...A.......D.......T...LREWVK-- R5NNM5.1/3-155 KKLVAYFS...........A...S...........G...........I.....TRNVAKMVA.E.A....A..G..AD..L..YEITP............K...E...AY..T...K...A..D...L...N..W.M..............D.K..K.S.....R.S...S.....V...E.M..T....D..K.K..I......R..P...E..I..T...D...T...D..A..K..I..S...........E...YDEIFLGFPIW.W.Y.V.APTIINT.FL..E..K..Y....D..F.T..G.K...K..IVLFAT...S.G.G...S..G...F.GN......T..VKEL...Q.P.......S.A..P.G..A.Q.F.V.E.....G...R.L..L....N.H...A...N.......K...Ke....ieE.......L...VTE----- A0A3A9FDZ6.1/4-156 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KVLVAYFS...........A...S...........G...........V.....TAKVAGKLA.E.T....I..D..AK..L..YEIEP............E...Q...PY..T...N...D..D...L...N..W.Q..............N.K..M.S.....R.S...S.....V...E.M..N....D..K.N..S......R..P...A..I..K...T...S...V..D..D..M..D...........Q...YETVFVGFPIW.W.Y.R.EPSIIDT.FM..E..S..Y....D..F.S..G.K...T..IIPFAT...S.G.G...S..G...M.GE......S..TNIL...Q.S.......I.A..G.D..A.K.V.V.Q.....G...K.R..F....S.S...N...V.......S...L.......D.......E...LNNWA--- R9M1A6.1/84-236 KTLVLYFS...........A...S...........G...........N.....TKAVAETIA.T.A....A..G..SE..L..YELTP............A...E...PY..T...S...D..D...L...R..W.T..............N.P..D.S.....R.V...N.....T...E.H..N....D..P.A..H......R..T...A..I..A...G...E...L..P..D..L..A...........A...YDTIFLGYPLW.W.R.E.APSIVWN.FM..E..N..A....D..L.S..G.K...T..IIPFCT...S.T.S...D..G...I.EG......S..VETL...R.G.......M.A..P.A..A.N.W.M.Q.....G...R.R..F....G.E...N...L.......N...E.......S.......A...VTQWVN-- R9M1A6.1/301-412 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KTLVAYFS...........T...S...........G...........N.....TEKLAKKLA.D.V....I..N..AD..L..HEIKP............V...E...KY..R...P...A..D...L...D..W.T..............N.K..K.S.....R.S...S.....I...E.M..N....D..R.K..L......R..P...Q..I..A...N...K...V..E..N..M..E...........E...YDKIFVGFPIW.W.Y.I.APTIINT.FL..E..Q..Y....D..L.K..G.K...V..IIPIAT...S.G.G...S..E...I.GD......T..NKEL...Q.A.......S.C..V.G..A.D.L.K.L.....G...K.V..F....S.P...K...V.......D...D.......D.......E...LKQWA--- A0A1Y4SCF6.1/3-155 KILVSYFS...........A...S...........G...........V.....TARVAQKLS.Q.A....I..D..GD..L..HEIIP............A...Q...PY..S...Q...A..D...L...D..W.T..............N.P..Q.S.....R.S...S.....Q...E.M..K....N..K.A..Y......R..P...A..I..Q...N...E...V..K..N..M..D...........D...YDVIFIGFPIW.W.Y.V.APTIINT.FL..E..Q..Y....D..L.S..G.K...T..IIPFAT...S.G.G...S..G...M.GN......T..TQEL...K.V.......S.C..G.N..A.K.L.C.Q.....G...R.R..F....D.S...Q...V.......D...V.......D.......T...LKTWAE-- A0A239TVJ2.1/58-210 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