# STOCKHOLM 1.0 #=GF ID Flavodoxin_4 #=GF AC PF12682.10 #=GF DE Flavodoxin #=GF AU Mistry J;0000-0003-2479-5322 #=GF GA 24.0 24.0 #=GF NC 23.8 23.9 #=GF TC 24.0 24.0 #=GF SE Manual #=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann #=GF SM hmmsearch -Z 61295632 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq #=GF TP Domain #=GF CL CL0042 #=GF DR INTERPRO; IPR008254; #=GF DR SO; 0000417; polypeptide_domain; #=GF CC This is a family of flavodoxins. Flavodoxins are electron #=GF CC transfer proteins that carry a molecule of non-covalently bound #=GF CC FMN. #=GF SQ 2021 Q5L808.1/5-159 KILVAYFS...........C...S...........G...........V.....TKAVAEKL.A.A.I....T.......G..........AD..L..YEI....K.P............E...V...PY..T...E...A..D...L...D..W..N..............D...K..K.S.....R..S...S.....V.....E...M..R....D..A.L..S......R......P...A..I.......S...G...T...L...F..H..P...E...........K...Y....EVLFVGFP.VW.W.Y.I.APTIINT.FL..E...S...Y.....D..F....A..G..K...I..VVPFA...T...S.G.G......S..G...I....GN......C..E....KNL....H...K.......A.Y..P....D......I.V.W.K.D.....G...K.L..L....N..G...Q...I.......T.......R.......D.......L...VT..EWFEKI R6YAG2.1/6-159 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KTLVVYFS...........A...T...........G...........N.....TERVAKLI.S.T.A....T.......Q..........AD..L..YKI....Q.P............A...K...AY..T...S...A..D...L...D..W..H..............N...K..S.S.....R..S...S.....V.....E...M..N....D..A.K..A......R......P...E..L.......D...G...S...V...P..N..W...A...........D...Y....TTIYLGYP.IW.W.D.Q.APRIINS.FI..E...S...Q.....D..F....A..G..K...T..VIPFA...T...S.G.G......S..S...I....SH......S..V....QEL....K...K.......T.Y..P....S......I.H.W.Q.Q.....G...K.L..L....N..G...A...T.......P.......S.......D.......I...-S..NWIQ-- A0A4T9WEX7.1/3-156 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KILVAYFS...........C...T...........G...........N.....TENAAQKI.A.T.A....T.......G..........GD..L..YAI....T.P............A...E...PY..T...A...D..D...L...R..Y..N..............D...D..T.T.....R..A...T.....K.....E...Q..H....D..T.S..I......R......P...A..L.......A...G...T...V...D..N..F...Q...........Q...Y....DVIFVGYP.IW.W.D.Q.APRVINT.FL..E...S...Y.....D..F....S..G..K...K..VIPFC...T...S.G.G......S..T...I....TN......S..A....NQL....K...S.......T.Y..S....N......M.N.W.L.D.....G...R.L..I....G..R...S...T.......S.......Q.......D.......E...IA..AWID-- R5FD71.1/34-185 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-ILVAYFS...........A...T...........G...........T.....TKTLAGYI.S.E.V....T.......G..........GD..L..YEI....V.P............E...I...PY..S...S...E..D...L...N..Y..S..............D...N..N.S.....R..S...T.....R.....E...Q..N....D..E.G..A......R......P...A..I.......S...G...S...V...E..D..M...D...........Q...Y....GTIFLGYP.IW.W.G.E.APRIIDT.FM..E...S...Y.....D..F....S..G..K...T..IVPFC...T...S.G.G......S..G...I....GA......S..A....RNL....H...D......lA.A..S....D......V.T.W.L.D.....G...E.R..L....S..S...D...I.......S.......H.......E.......E...MV..SWID-- A0A4Y1X5E0.1/34-185 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KTLVVYYS...........A...T...........G...........N.....TESVAGYI.A.A.A....T.......D..........AD..I..FVL....E.P............V...E...PY..S...S...E..D...L...D..W..T..............D...K..D.S.....R..V...T.....R.....E...H..En..eD..E.R..N......V......E...L..V.......S...A...T...V...D..N..W...E...........S...Y....DTVFIGYP.IW.W.H.I.AAWPVDG.FI..A...A...N.....D..F....T..G..K...T..VIPFC...T...S.S.S......S..D...L....GE......S..G....ELL....E...E.......A.A..G....T......G.N.W.L.E.....G...E.R..F....S..S...S...A.......S.......E.......E.......T...VR..AWVES- A0A4Y9ISX7.1/32-171 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RILVAYFS...........R...S...........G...........N.....TRVIAGVI.H.R.S....L.......N..........TD..L..FEI....E.P............A...T...PY..P...E...D..Y...F...Q..T..V..............E...Q..-.-.....-..-...A.....K.....N...E..R....E..R.G..V......K......P...A..L.......K...N...S...V...T..D..I...P...........R...Y....ETVYLGFP.IW.G.T.S.VPPVVQT.FL..S...S...H.....N..L....A..G..K...L..LIPFI...T...H.G.G......Y..G...K....GD......S..D....DIL....A...S.......L.A..P....T......A.R.R.E.K.....P...L.V..L....E..C...DqerR.......T.......T.......E.......T...VT..SWLETI A0A1H7J3A2.1/38-163 KVLVAYFS...........R...S...........G...........N.....TRVIAGLL.Q.R.A....F.......Q..........AD..L..FEI....V.P............A...T...AY..P...D...E..Y...L...A..T..V..............E...E..-.A.....R..Q...E.....-.....R...D..R....D..A.-..A......R......P...-..L.......R...A...T...V...A..H..L...A...........P...Y....DTVYLGFP.IW.G.T.T.APPVIKG.FL..K...A...H.....D..L....A..G..K...Q..VVPFI...T...H.G.G......Y..G...L....GD......S..Q....AVL....R...R.......L.A..P....Q......-.-.-.-.-.....-...-.-..-....-..-...-...-.......-.......-.......-.......-...--..------ A0A2U1S866.1/3-117 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KVLIVYLS...........R...T...........Q...........N.....TKAVADII.Q.E.A....V.......G..........GD..S..VAL....E.L............E...T...PY..P...E...-..-...-...D..Y..D..............A...I..V.A.....Q..-...V.....D.....E...E..N....E..T.G..Y......L......P...P..L.......K...T...E...I...E..N..I...D...........G...Y....DTVFVGFP.TW.D.M.Q.MPPPMKS.FL..H...E...N.....N..L....S..G..K...R..VIPFN...T...H.G.G......Y..G...V....GS......G..F....ETV....E...M.......L.C..S....E......S.T.-.-.-.....-...-.-..-....-..-...-...-.......-.......-.......-.......-...--..------ G0VRZ4.1/99-223 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