# STOCKHOLM 1.0 #=GF ID aBig_2 #=GF AC PF20578.1 #=GF DE Atrophied bacterial Ig domain #=GF AU Bateman A;0000-0002-6982-4660 #=GF GA 27.0 27.0 #=GF NC 26.9 26.9 #=GF TC 27.0 27.0 #=GF SE Bateman A #=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann #=GF SM hmmsearch -Z 61295632 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq #=GF TP Domain #=GF DR SO; 0000417; polypeptide_domain; #=GF CC This domain is related to Pfam:PF02368 a bacterial #=GF CC immunoglobulin-like domain. According to structure predictions #=GF CC members of this domain family have lost several beta strands #=GF CC found on one sheet of the Ig domain. This domain is found in a #=GF CC wide range of bacterial cell surface proteins. #=GF SQ 872 A0A6B8RQX9.1/408-495 -AADKTAL...T....LG....FRGS.D...NA....TKV.T...Q..D.I.DL.T.......T..E.....GA...N.....G...S.T.....V.TW..A..S.Y..N.P.....LT...Va...............isT...YS............A......T....V....TR...P..-.-.....TD........A......D.VT...FNLTAT.LK..KGD...........A.T.T..T.Q.VFPIKVLQ- A0A6B8RQX9.1/511-594 --------...-....--....--TF.S...AI....TDV.T...Q..N.L.DL.P.......I..T.....GL...N.....G...T.T.....I.NW..S..S.D..N.Aa...iAV...V..................G...TK............G......V....V....SR...A..V.T.....AE........GgidgalD.VN...VTLEAT.IS..KIG..........tP.D.K..T.Q.DFVVKVLD- A0A6B8RQX9.1/602-689 -AEASSAL...L....IG....YTGS.E...SA....ASV.S...R..N.V.TL.P.......I..A.....GL...N.....G...T.T.....V.SW..S..A.N..P.T.....GI...I..................A...DStdp......thlG......I....V....TM...P..A.A.....--........-......I.TV...VKLTAT.IS..KNG...........T.T.A..T.K.VFDLSM--- A0A6B8RQX9.1/708-784 --------...T....YS....VGSS.D...TR....ASV.T...Q..R.V.YL.K.......T..S.....DT...N.....G...T.T.....I.TW..V..S.S..N.P.....AV...I..................S...TT............G......L....V....TR...P..-.-.....AS........A......N.AV...VTLTAT.IK..KNS...........A.T.A..T.I.AIPLTVI-- A0A6B8RQX9.1/793-876 --AAKAAL...A....IT....YATG.D...SL....AKV.T...R..N.L.SL.P.......D..I.....GL...N.....G...T.V.....V.TW..A..S.N..K.P.....LV...V..................S...AS............G......E....V....FR...P..-.-.....TD........A......D.AT...VILTAN.LT..KNL...........E.H.T..T.K.DFTLKIFQ- A0A6B8RQX9.1/882-975 VAAAKAAL...A....IS....YGVG.D...NVgvllGKA.I...K..N.M.KL.A.......T..V.....GT...N.....G...T.T.....I.QW..I..S.S..S.P.....TV...I..................S...AT............G......I....V....TR...N..A.F.....--........E......D.VT...VTLTAK.IS..KTSip......nspE.I.V..E.K.KFDIIVP-- A0A6B8RQX9.1/984-1069 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VASAKKAL...A....IG....YMTG.D...SK....QSV.T...G..D.V.TL.P.......T..A.....GV...S.....G...T.T.....I.SW..A..S.S..D.T.....SV...V..................A...TN............G......T....V....TR...P..T.Y.....GM........E......D.QV...VTLTAT.IT..KGT...........A.S.N..T.R.TFTVTVK-- A0A401I9S0.1/326-413 VAAAKNAL...V....VG....YITG.D...SA....NSV.T...A..D.V.TL.P.......T..T.....GA...S.....D...T.A.....I.SW..S..S.S..D.T.....SV...I..................A...TN............G......A....V....AR...P..S.Y.....NM........G......D.QL...VTLTAT.IT..KGT...........E.S.D..T.Q.EFKLTVKA- A0A401I9S0.1/422-509 VAAAKNAL...V....VG....YITG.D...SA....SSV.T...A..N.V.TL.P.......T..T.....GA...S.....D...T.A.....I.NW..S..S.S..D.T.....SV...I..................A...PN............G......A....V....AR...P..S.Y.....DT........G......D.QI...ITLIAT.IT..KGT...........E.S.D..T.Q.EFTLTVKA- A0A401I9S0.1/518-605 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